Dalyko (modulio) pavadinimas Bioinformatika
|
|
|
- Gordon McKinney
- 5 years ago
- Views:
Transcription
1 BIOINFORMATIKOS DALYKO APRAŠAS Dalyko (modulio) pavadinimas Kodas Bioinformatika Dėstyjas (-ai) Padalinys (-iai) Koordinuojantis: Dr. Doc. V. Kairys Matematikos ir informatikos fakultetas, Studijų pakopa Dalyko (modulio) lygmuo Dalyko (modulio) tipas 1 pakopa - Privalomas Įgyvendinimo forma Vykdymo laikotarpis Vykdymo kalba (-os) Paskais 4 semestras Lietuvių Reikalavimai studijuojančiajam Išankstiniai reikalavimai: Gretutiniai reikalavimai (jei yra): Biochemija; Genetikos pagrindai; Matematinė Nėra analizė ir diferencialinės lygtys Dalyko (modulio) apimtis kreditais Visas studen darbo krūvis Kontaktinio darbo valandos Dalyko (modulio) tikslas: studijų programos ugdomos kompetencijos Savarankiško darbo valandos Studentai sugebės spręsti taikomuosius biologijos ir genetikos uždavinius, supras struktūrinių duomenų panaudojimo galimybes, mokės įvertinti jų patikimumą, naudotis kai kuriais struktūrų nusakymo medais. Dalyko (modulio) studijų siekiniai Studijų medai Vertinimo medai...gebės apdoroti duomenis kompiuteriniais medais...gebės planuoti ir vykdyti eksperimentus, apdoroti gautus rezultatus naudojantis matematiniais medais ir duomenų bazėmis....mokės susirasti reikalingą informaciją internete ir mokslinėse duomenų bazėse, tinkamai ją analizuoti ir taikyti iškilusiems uždaviniams spręsti Temos Prieš kiekvieną paskaitą studentai savarankiškai susipažįsta su kiekvieno būsimo užsiėmimo tema. Kurso medžiaga išdėsma paskaise, kurių metu supažindinama su bioinformatikos problematika ir problemų sprendimo konkrečių programų pagalba galimybėmis. Žinios įtvirtinamos užsiėmimuose kompiuterinėje klasėje, kur, vadovaujant dėstyjui, studentai mokosi atlikti konkrečias praktines užduotis. Studentams savarankiškai dirbant su konkrečiomis programomis jie gali kreiptis į konsultuojantį dėstyją kaip darbo klasėje metu, taip ir kitu laiku (pvz., per elektroninį paštą) Kontaktinio darbo valandos Užduotys užsiėmimų metu ir savarankiškos. Testinės užduotys. Savarankiškų studijų laikas ir užduotys
2 1. Įvadas į bioinformatiką. Mutacijos, genai. GenBank as, jo turinys. 2. NCBI paieškų sistema Entrez. RefSeq anotuos sekos. Monogeninių sutrikimų duomenų bazė OMIM. Pirminės ir antrinės duomenų bazės. Uniprot baltymų duomenų bazė. Genomo naršyklės. 3. Homologija. Baltymų motyvai, domenai. Sekų sulyginimas. Sulyginimo gerumo įvertinimas. Identiškumo matrica. Taškinės matricos medas. Judančio lango medas. 4. PAM, BLOSUM sulyginimo įvertinimo matricos, jų išvedimas, taikymas įvairiose praktinėse situacijose. Paskais Konsultacijos Seminarai Pratybos Laborariniai darbai Praktika Visas kontaktinis darbas Savarankiškas darbas Užduotys Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos
3 5. Needleman/Wunsch ir Smith/Waterman sulyginimo algoritmai. Tarpų (insercijų, delecijų) nuobauda. 6. BLAST sulyginimas ir algoritmas. Statistiniai sulyginimo rodikliai (E-value, Z-score ir pan.) BLAST parametrai ir jų praktinis taikymas. 7. PHI-BLAST. PSI-BLAST. Sulyginimo programos ir DB, naudojančios Markovo modelius. 8. Daugybiniai sekų sulyginimai. ClustalW, jo išvedimas. Kis daugybinio sekų sulyginimo programos. 9. Filogenetiniai medžiai, jų tipai, atstumų tarp sekų tipai, medžių konstravimo programos. Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos
4 10. Tridimensinės baltymų struktūros, jų vizualizacija. 11. Baltymų struktūros pagrindai. Ramačandrano schemos. Antrinė, tretinė, ketvirtinė struktūros. PDB, mmcif formatai. PDB duomenų bankai. Kis pirminės ir antrinės struktūrinių duomenų bazės. 12. Struktūrinių medų tikslumas. Struktūrų klaidos, jų detekcija. Erdvinių struktūrų sulyginimai. 13. Struktūrų sanklodos. SCOP, CATH duomenų bazės. Antrinės struktūros aumatinis nustatymas. Domenų nustatymo programos. 14. Baltymo funkcijos nuspėjimas. Antrinės struktūros nuspėjimas. Specialūs modeliavimo aspektai: prieinamumas tirpikliui, transmembraninių regionų Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos Paskais medžiagos
5 nuspėjimas. 15. Homologinis modeliavimas, Paskais medžiagos sanklodos nustatymas, ab initio modeliavimas. Kilpų modeliavimas. Šoninių grandinių modeliavimas. 16. Homologinio modeliavimo Paskais medžiagos serveriai. Erdvinės baltymų struktūros modeliavimo varžybos: CASP ir kis. Paskutiniųjų CASP (CASP10) varžybų rezultatų apžvalga. 17. Egzaminas 6 Pasiruošimas egzaminui Iš viso Vertinimo Svoris Atsiskaitymo Vertinimo kriterijai strategija proc. laikas Egzaminas 100% Sesijos metu Egzamine pateikti 3 teoriniai atviro tipo klausimai (70%) ir praktinių darbų užduotys (30%). Egzamino vertinimas : Išlaikyta 10 (puikiai) - 92% 9 (labai gerai) 82 91% 8 (gerai) 74 81% 7 (vidutiniškai) 66-73% 6 (patenkinamai) 58-65% 5 (silpnai) 50-57% Neišlaikyta 4 (nepatenkinamai) 40-49% % % 1-19% Aurius Leidimo metai Pavadinimas Periodinio leidinio Nr. Leidimo vieta ir leidykla ar internetinė nuoroda ar leidinio mas Privalomoji literatūra J. Gu, Ph. E. Bourne 2009 Structural Bioinformatics Wiley-Blackwell (eds.) (2nd ed.)
6 Arthur M. Lesk 2002 Bioinformatics. Papildoma literatūra Įvairūs auriai Paskaitų medžiaga internete J. Pevsner 2009 Bioinformatics and Functional Genomics (2nd ed.) Oxford University Press Pvz., e/online_lectures.html Wiley-Liss
Dalyko (modulio) pavadinimas INFORMACINIŲ TECHNOLOGIJŲ TAIKYMAS MIKROBIOLOGIJOJE
Dalyko (modulio) pavadinimas INFORMACINIŲ TECHNOLOGIJŲ TAIKYMAS MIKROBIOLOGIJOJE Kodas Dėstytojas (-ai) Koordinuojantis: dr. JUOZAS RAUGALAS Kitas (-i): Padalinys (-iai) Gamtos mokslų fakultetas: Mikrobiologijos
MIKROORGANIZMŲ GENETIKOS DALYKO APRAŠAS. Dalyko (modulio) pavadinimas Mikroorganizmų genetika
MIKROORGANIZMŲ GENETIKOS DALYKO APRAŠAS Dalyko (modulio) pavadinimas Mikroorganizmų genetika Kodas Dėstytojas (-ai) Padalinys (-iai) Koordinuojantis: lekt. dr. Eglė Lastauskienė Vilniaus universitetas,
Studijų pakopa Dalyko (modulio) lygmuo Dalyko (modulio) tipas
VIRUSOLOGIJA Dalyko (modulio) pavadinimas Kodas Dėstytojas (-ai) Koordinuojantis: doc. ELENA BAKIENĖ Kitas (-i): Padalinys (-iai) Gamtos mokslų fakulteto Biochemijos ir molekulinės biologijos katedra Studijų
Matematikos ir informatikos institutas. Informatikos doktorantūros modulis Statistinis modeliavimas ir operacijų tyrimas
Matematikos ir informatikos institutas Informatikos doktorantūros modulis Statistinis modeliavimas ir operacijų tyrimas Rengė: prof. habil. dr. Leonidas Sakalauskas 2007 INFORMATIKOS KRYPTIES DOKTORANTŪROS
DALYKO (MODULIO) APRAŠAS. Studijų pakopa Dalyko (modulio) lygmuo Dalyko (modulio) tipas Pirmoji 1/1 Privalomasis
MIKROBIOLOGIJA DALYKO (MODULIO) APRAŠAS Dalyko (modulio) pavadinimas Kodas Dėstytojas (-ai) Koordinuojantis: prof. Donaldas Čitavičius Kitas: Raimonda Petkauskaitė Padalinys (-iai) Gamtos mokslų fakultetas,
LIETUVOS MUZIKOS IR TEATRO AKADEMIJA MUZIKOS FAKULTETAS s. m. STUDIJŲ PROREKTORĖ DOC. DR. V. UMBRASIENĖ TVARKARAŠTIS
SUDRINTA: DKANĖ PROF. A. MOTUZINĖ LITUVOS MUZIKOS IR TATRO AKADMIJA MUZIKOS FAKULTTAS 2017-2018 s. m. PAVASARIO SMSTRO PASKAITŲ TVARKARAŠTIS TVIRTINU: STUDIJŲ PRORKTORĖ DOC. DR. V. UMBRASINĖ KUR SAS BAKALAURO
Programų sistemų inžinerija
Programų sistemų inžinerija Modulio tikslai, struktūra, vertinimas Lina Vasiliauskienė Grafinių sistemų katedra Vilniaus Gedimino Technikos Universitetas 2010 2011 Kontaktai Dėstytoja Lina Vasiliauskienė
MATEMATINĖ STATISTIKA IR INFORMATIKA BIOMEDICINOJE
LIETUVOS SVEIKATOS MOKSLŲ UNIVERSITETAS KAUNO MEDICINOS UNIVERSITETAS PATVIRTINTA Kauno medicinos universiteto Senato 2004 m. gruodžio 17 d. Nutarimu 3-11 ATNAUJINTA 2013 m. spalio mėn. MATEMATINĖ STATISTIKA
Pagrindini studij programa EKONOMETRIJA. Pirmas kursas I semestras. Akademinis darbas Dalyko pavadinimas kodas. Antras kursas III semestras
stojusiems 2009m.,2010 m. Studij sritis: fiziniai mokslai Pagrindini studij programa EKONOMETRIJA Pirmas kursas I semestras Studij kryptis: statistika Sando Akademinis darbas Dalyko pavadinimas Kr kodas
Pagrindinių studijų programa EKONOMETRIJA. Akademinis darbas Dalyko pavadinimas kodas
Pagrindinių studijų programa EKONOMETRIJA Studijų sritis: fiziniai mokslai Studijų kryptis: statistika Pirmas kursas I semestras Sando Akademinis darbas Dalyko pavadinimas Kr kodas P Pr S K L A Matematinė
Matematikos ir informatikos institutas. Informatikos doktorantūros modulis Informatikos mokslo tyrimų metodai ir metodika. Rengė: Prof. A.
Matematikos ir informatikos institutas Informatikos doktorantūros modulis Informatikos mokslo tyrimų metodai ir metodika Rengė: Prof. A. Čaplinskas 2007 INFORMATIKOS KRYPTIES DOKTORANTŪROS STUDIJŲ MODULIO
PROTEOMIKA. Rūta Navakauskienė. El.paštas:
PROTEOMIKA Rūta Navakauskienė El.paštas: ruta.navakauskiene@bchi.lt Literatūra Simpson, Richard J. Proteins and proteomics: a laboratory manual. Cold Spring Harbor (N.Y.): Cold Spring Harbor. Laboratory
NUOTOLINIŲ KURSŲ OPTIMIZAVIMAS
Vilniaus Universitetas Matematikos ir informatikos institutas L I E T U V A INFORMATIKA (09 P) NUOTOLINIŲ KURSŲ OPTIMIZAVIMAS Irina Vinogradova 2013 m. spalis Mokslinė ataskaita MII-DS-09P-13-5 Matematikos
Course type (compulsory or optional) Semester the course is delivered Study form (face-to-face or distant)
COURSE DESCRIPTION (Group C) Course Volume in Course Course code Course valid to group ECTS credits valid from POLN30 C 5 Reg. No. Course type (compulsory or optional) Course level (study cycle) Semester
Vango algoritmo analizė
VILNIAUS GEDIMINO TECHNIKOS UNIVERSITETAS 2017 m. balandžio 18 d. Problemos formulavimas Nagrinėkime lygtį u t = i 2 u, t [0, T ], x Ω x 2 u t=0 = u 0 (x). (1) Problema Realybėje Ω (, ), kas verčia įvesti
MATEMATINIO MODELIAVIMO KATEDRA
MATEMATINIO MODELIAVIMO KATEDRA Dėstytojas: Raimondas Čiegis "Keliaujančio pirklio uždavinio sprendimo modernių algoritmų efektyvumo palyginimas" Keliaujančio pirklio uždavinys yra svarbus NP sudėtingumo
Europass Gyvenimo aprašymas
Europass Gyvenimo aprašymas Asmeninė informacija Vardas Pavardė El. paštai Pilietybė Laura Gudelytė gudelyte.l@gmail.com ; l.gudelyte@mruni.lt Lietuvos Gimimo data 1984 02 08 Lytis Moteris Darbo patirtis
CS612 - Algorithms in Bioinformatics
Fall 2017 Databases and Protein Structure Representation October 2, 2017 Molecular Biology as Information Science > 12, 000 genomes sequenced, mostly bacterial (2013) > 5x10 6 unique sequences available
KVALIFIKACIJŲ IR PROFESINIO MOKYMO PLĖTROS CENTRAS
KVALIFIKACIJŲ IR PROFESINIO MOKYMO PLĖTROS CENTRAS JAVA PROGRAMUOTOJO MODULINĖ PROFESINIO MOKYMO PROGRAMA Programos valstybinis kodas: 440048254 Suteikiama kvalifikacija: Jaunesnysis Java programuotojas
Algebraic and spectral analysis of local magnetic field intensity
Lietuvos matematikos rinkinys ISSN 132-2818 Proc. of the Lithuanian Mathematical Society, Ser. A Vol. 6, DOI:.388/LMR.A.. pages 4 9 Algebraic and spectral analysis of local magnetic field intensity Mantas
DATA ACQUISITION FROM BIO-DATABASES AND BLAST. Natapol Pornputtapong 18 January 2018
DATA ACQUISITION FROM BIO-DATABASES AND BLAST Natapol Pornputtapong 18 January 2018 DATABASE Collections of data To share multi-user interface To prevent data loss To make sure to get the right things
7Integruotų studijų programų
90 P R O F E S I N I S R E N G I M A S : T Y R I M A I I R R E A L I J O S 2 0 0 7 / 1 3 7Integruotų studijų programų rengimo ir įgyvendinimo aspektai Onutė Junevičienė A N O T A C I J A Straipsnyje pateiktas
Kurso tikslai. 1 Įgyti galimybę skaitiškai spręsti taikomuosius uždavinius; 2 Įvertinti skirtingus skaitinius sprendimo metodus (žinant jų
Kurso tikslai Skaitiniai metodai Kompiuterių aritmetika ir algoritmai Olga Štikonienė Diferencialinių lygčių ir skaičiavimo matematikos katedra, MIF VU 01-0-05 Skaitiniai metodai (MIF VU) Komp.aritmetika
MATHEMATICAL MODELS FOR SCIENTIFIC TERMINOLOGY AND THEIR APPLICATIONS IN THE CLASSIFICATION OF PUBLICATIONS
VILNIUS GEDIMINAS TECHNICAL UNIVERSITY INSTITUTE OF MATHEMATICS AND INFORMATICS Vaidas BALYS MATHEMATICAL MODELS FOR SCIENTIFIC TERMINOLOGY AND THEIR APPLICATIONS IN THE CLASSIFICATION OF PUBLICATIONS
Large-Scale Genomic Surveys
Bioinformatics Subtopics Fold Recognition Secondary Structure Prediction Docking & Drug Design Protein Geometry Protein Flexibility Homology Modeling Sequence Alignment Structure Classification Gene Prediction
ŠIAULIŲ UNIVERSITETAS MATEMATIKOS IR INFORMATIKOS FAKULTETAS INFORMATIKOS KATEDRA. Remigijus Valčiukas
ŠIAULIŲ UNIVERSITETAS MATEMATIKOS IR INFORMATIKOS FAKULTETAS INFORMATIKOS KATEDRA Remigijus Valčiukas Informatikos specialybės magistrantūros II kurso dieninio skyriaus studentas Internetinė matematinio
Struktūrinė geologija
Pirmadienį pirmą pusdienį Struktūrinė geologija Audrius Čečys audrius.cecys@gf.vu.lt / audrius.cecys@gmail.com + 370 686 96 480 http://web.vu.lt/gf/a.cecys ir Dropbox Struktūrinė geologija yra mokslas
Syllabus of BIOINF 528 (2017 Fall, Bioinformatics Program)
Syllabus of BIOINF 528 (2017 Fall, Bioinformatics Program) Course Name: Structural Bioinformatics Course Description: Instructor: This course introduces fundamental concepts and methods for structural
1 Kompiuterių aritmetika ir algoritmai. 2 Tiesinių lygčių sistemų sprendimo metodai: 3 Duomenų aproksimacija: 4 Tikrinių reikšmių uždavinys.
Skaitiniai metodai Skaitiniai metodai Kompiuterių aritmetika ir algoritmai Olga Štikonienė Diferencialinių lygčių ir skaičiavimo matematikos katedra, MIF VU 24-2-4 Skaitiniai metodai randa matematinių
VILNIUS UNIVERSITY LIJANA STABINGIENĖ IMAGE ANALYSIS USING BAYES DISCRIMINANT FUNCTIONS
VILNIUS UNIVERSITY LIJANA STABINGIENĖ IMAGE ANALYSIS USING BAYES DISCRIMINANT FUNCTIONS Summary of doctoral dissertation Physical sciences (P 000) Informatics (09 P) Vilnius, 2012 Doctoral dissertation
G4120: Introduction to Computational Biology
ICB Fall 2003 G4120: Introduction to Computational Biology Oliver Jovanovic, Ph.D. Columbia University Department of Microbiology Copyright 2003 Oliver Jovanovic, All Rights Reserved. Bioinformatics and
ALGOLOGIJOS IR MIKOLOGIJOS PAGRINDAI kodas ALMI2112, apimtis 4kreditai Studijų programa: Ekologijos I pakopos, programos kodas: 61203B106
2007-2013 m. Žmogiškųjų išteklių pl tros veiksmų programos 2 prioriteto Mokymasis visą gyvenimą VP1-2.2-ŠMM-09-V priemon Studijų programų pl tra Nacionalin se kompleksin se programose Projekto SFMIS arba
METHODS FOR GENERATION OF RANDOM NUMBERS IN PARALLEL STOCHASTIC ALGORITHMS FOR GLOBAL OPTIMIZATION
METHODS FOR GENERATION OF RANDOM NUMBERS IN PARALLEL STOCHASTIC ALGORITHMS FOR GLOBAL OPTIMIZATION Algirdas Lančinskas, Julius Žilinskas Institute of Mathematics and Informatics 1. Introduction Generation
Tranzistoriai. 1947: W.H.Brattain and J.Bardeen (Bell Labs, USA)
LTRONOS ĮTASA 2009 1 Tranzistoriai 1947: W.H.Brattain an J.Bareen (Bell Labs, USA) JPPi J.P.Pierce (Bell lllabs): tran(sfer)+(re)sistor ( ) t = transistor. t 1949: W.Schockley pasiūlė plokštinio vipolio
Week 10: Homology Modelling (II) - HHpred
Week 10: Homology Modelling (II) - HHpred Course: Tools for Structural Biology Fabian Glaser BKU - Technion 1 2 Identify and align related structures by sequence methods is not an easy task All comparative
Protein Structure Prediction 11/11/05
11/11/05 Protein Structure Prediction & Modeling Bioinformatics Seminars Nov 11 Fri 12:10 BCB Seminar in E164 Lago Building Supertrees Using Distances Steve Willson, Dept of Mathematics http://www.bcb.iastate.edu/courses/bcb691-f2005.html
Introduction to Bioinformatics
Introduction to Bioinformatics Jianlin Cheng, PhD Department of Computer Science Informatics Institute 2011 Topics Introduction Biological Sequence Alignment and Database Search Analysis of gene expression
Geografinė informacinė sistema (GIS) galimybės mokymui (si) ir kūrybai. Dr. Jurgita Rimkuvienė
Geografinė informacinė sistema (GIS) galimybės mokymui (si) ir kūrybai Dr. Jurgita Rimkuvienė 2015-09-18 Geografinės informacinės sistemos (GIS) GIS - tai įrankis, galintis padėti visiems besimokantiesiems
LIETUVOS ENERGETIKOS STRATEGIJA: OPTIMALIOS RENOVACIJOS MODELIS (ORM) (projektas pastaboms)
Įvadas LIETUVOS ENERGETIKOS STRATEGIJA: OPTIMALIOS RENOVACIJOS MODELIS (ORM) (projekas pasaboms) ORM yra kašų ir naudos analiz s (cos-benefi analysis) aikymas svarbiu masin s daugiabučių renovacijos aveju,
Nijolė Cibulskaitė, Kristina Baranovska
MATEMATIKOS VADOVĖLIŲ V KLASEI VERTINIMAS DALYKINIU, PEDAGOGINIU IR PSICHOLOGINIU POŽIŪRIAIS Anotacija. Beveik du Nepriklausomybės dešimtmečius pertvarkant Lietuvos švietimą ypač daug dėmesio buvo skiriama
Protein function prediction based on sequence analysis
Performing sequence searches Post-Blast analysis, Using profiles and pattern-matching Protein function prediction based on sequence analysis Slides from a lecture on MOL204 - Applied Bioinformatics 18-Oct-2005
KAUNO TECHNOLOGIJOS UNIVERSITETAS INFORMATIKOS FAKULTETAS MULTIMEDIJOS INŽINERIJOS KATEDRA
KAUNO TECHNOLOGIJOS UNIVERSITETAS INFORMATIKOS FAKULTETAS MULTIMEDIJOS INŽINERIJOS KATEDRA Žydronė Ramoškaitė INTERAKTYVIŲ TECHNOLOGIJŲ TAIKYMAS DĖSTANT 7-OS KLASĖS MATEMATIKOS KURSĄ TRIKAMPIŲ PLOTAI Magistro
6 programų moduliai dualinės mokymo sistemos dalyviams
Co-funded by the Erasmus+ programme of the European Union THE INTELLECTUAL OUTPUT NUMBER 2: INTELEKTUALINIS PRODUKTAS Nr. 2 The programmes of 6 modules for the actors of dual training 6 programų moduliai
THe use of mathematical models for modelling sulphur dioxide sorption on materials produced from fly ashes
ENERGETIKA. 2018. T. 64. Nr. 2. P. 105 113 Lietuvos mokslų akademija, 2018 THe use of mathematical models for modelling sulphur dioxide sorption on materials produced from fly ashes Natalia Czuma 1, Katarzyna
Stochastinės analizės egzaminas MIF magistrantūra, FDM I kursas, 2018 m. ruduo (1 semestras), X s db s, t 0.
Stochastinės analizės egzaminas MIF magistrantūra, FDM I kursas, 218 m. ruduo (1 semestras), 219 1 18 1. Prove the following: Proposition. If X t, t, is an Itô process and f C 3 (IR), then f ( ) ( ) t
We have: We will: Assembled six genomes Made predictions of most likely gene locations. Add a layers of biological meaning to the sequences
Recap We have: Assembled six genomes Made predictions of most likely gene locations We will: Add a layers of biological meaning to the sequences Start with Biology This will motivate the choices we make
VILNIUS UNIVERSITY MAŽVYDAS MACKEVIČIUS COMPUTER MODELING OF CHEMICAL SYNTHESIS AT HIGH TEMPERATURES
VILNIUS UNIVERSITY MAŽVYDAS MACKEVIČIUS COMPUTER MODELING OF CHEMICAL SYNTHESIS AT HIGH TEMPERATURES Summary of Doctoral Dissertation Physical Sciences, Informatics (09 P) Vilnius, 2013 Doctoral dissertation
STUDIJŲ RAŠTO DARBAI. Alfonsas Juška, Genovait Gedminien. Mokomoji knyga VILNIAUS GEDIMINO TECHNIKOS UNIVERSITETAS
VILNIAUS GEDIMINO TECHNIKOS UNIVERSITETAS Alfonsas Juška, Genovait Gedminien STUDIJŲ RAŠTO DARBAI UDK įrašomas leidykloje A. Juška, G. Gedminien. Studijų rašto darbai: mokomoji knyga. Vilnius: Technika,
METODINĖS REKOMENDACIJOS, SKIRTOS MATEMATIKOS MODULIŲ PROGRAMOMS 9-10 KL. ĮGYVENDINTI
1 P R O J E K T A S VP1-2.2-ŠMM-04-V-01-001 MOKYMOSI KRYPTIES PASIRINKIMO GALIMYBIŲ DIDINIMAS 14-19 METŲ MOKINIAMS, II ETAPAS: GILESNIS MOKYMOSI DIFERENCIJAVIMAS IR INDIVIDUALIZAVIMAS, SIEKIANT UGDYMO
Tarptautinių santykių studijų programa. Socialiniai mokslai
PATVIRTINTA Generolo Jono Žemaičio Lietuvos karo akademijos viršininko 2011 m. birželio d. įsakymu Nr. Tarptautinių santykių studijų programa Studijų programos aprašas: Studijų programos pavadinimas: Tarptautiniai
A NEW WAY OF LOOKING AT THE BARNUM EFFECT AND ITS LINKS TO PERSONALITY TRAITS IN GROUPS RECEIVING DIFFERENT TYPES OF PERSONALITY FEEDBACK
Online) ISSN 2345-0061. PSICHOLOGIJA. 2014 50 A NEW WAY OF LOOKING AT THE BARNUM EFFECT AND ITS LINKS TO PERSONALITY TRAITS IN GROUPS RECEIVING DIFFERENT TYPES OF PERSONALITY FEEDBACK Mykolas Simas Poškus
Turinys. Kurso struktūra. 2 Diferencialinės lygtys. 4 Matematinių modelių pavyzdžiai
Turins ir matematiniai modeliai 26 CHAPTER INTRODUCTION TO DIFFERENTIAL EQUATIONS paskaita Olga Štikonienė d Diferencialinių lgčių ir skaičiavimo matematikos d W. T katedra, MIF VU WHAT LIES AHEAD Throughout
Matematikos. 8 klasė TIMSS uždavinių pavyzdžiai
Tarptautinis matematikos ir gamtos mokslų tyrimas Trends in International Mathematics and Science Study TIMSS 2 Matematikos uždavinių pavyzdžiai 8 klasė Nacionalinis egzaminų centras Vilnius, 23 UDK 5(76.)
Analysis of genetic risk assessment methods
Lietuvos matematikos rinkinys ISSN 32-288 Proc. of the Lithuanian Mathematical Society, Ser. A Vol. 56, 25 DOI:.5388/LMR.A.25.9 pages 7 2 Analysis of genetic risk assessment methods Vytautas Tiešis, Algirdas
Testavimo su naudotojais metodai Panaudojamumo vertinimai Dr. Kristina Lapin
www.wordle.net Testavimas su naudotojais Mastymas garsiai Stebėjimai Apklausos Testavimo su naudotojais metodai Panaudojamumo vertinimai Dr. Kristina Lapin 1 Turinys Panaudojamumo testavimai Tiesioginiai
Phylogeny of structural domains of plant serine β-lactamase family proteins
biologija. 200. Vol. 56. No.. P. 8 DOI: 0.278/v005-00-002-5 lietuvos mokslų akademija, 200 lietuvos mokslų akademijos leidykla, 200 Phylogeny of structural domains of plant serine β-lactamase family proteins
Organizacijos veiklos procesų valdymas
ISSN 1392-1142 ORGANIZACIJŲ VADYBA: SISTEMINIAI TYRIMAI: 2010.56 Organizacijos veiklos procesų valdymas Straipsnyje apibūdinami organizacijos veiklos procesai, įrodomas tiesioginis integralinis ryšys tarp
III SEKCIJA INFORMACINĖS TECHNOLOGIJOS MOKYME
III SEKCIJA INFORMACINĖS TECHNOLOGIJOS MOKYME IŠŠŪKIAI MOKYMUI IR INFORMACINIŲ SISTEMŲ MOKYMO TURINYS Antanas Baskas Matematikos ir informatikos institutas Akademijos g. 4, 2600 Vilnius Aptariami projektų
Biologijos dalykø apraðymai. Kodo raidës BIO
121 Biologijos dalykø apraðymai Kodo raidës BIO 122 Vytauto Didþiojo universitetas BIO 101 BIOLOGIJA DALYKO APIMTIS 3 KREDITAI s doc.dr. A.Paulauskas Individualus savarankiðkas darbas 55 Referatas 15 Ið
Molecular Modeling. Prediction of Protein 3D Structure from Sequence. Vimalkumar Velayudhan. May 21, 2007
Molecular Modeling Prediction of Protein 3D Structure from Sequence Vimalkumar Velayudhan Jain Institute of Vocational and Advanced Studies May 21, 2007 Vimalkumar Velayudhan Molecular Modeling 1/23 Outline
Bioinformatics. Dept. of Computational Biology & Bioinformatics
Bioinformatics Dept. of Computational Biology & Bioinformatics 3 Bioinformatics - play with sequences & structures Dept. of Computational Biology & Bioinformatics 4 ORGANIZATION OF LIFE ROLE OF BIOINFORMATICS
Panaudojamumo vertinimai Dr. Kristina Lapin
www.wordle.net Testavimas su naudotojais Mastymas garsiai Stebėjimai Apklausos Testavimas su naudotojais Panaudojamumo vertinimai Dr. Kristina Lapin 1 Turinys Panaudojamumo testavimai Tiesioginiai Panaudojamumo
Homology Modeling (Comparative Structure Modeling) GBCB 5874: Problem Solving in GBCB
Homology Modeling (Comparative Structure Modeling) Aims of Structural Genomics High-throughput 3D structure determination and analysis To determine or predict the 3D structures of all the proteins encoded
NACIONALINĖS ŽEMĖS TARNYBOS PRIE ŽEMĖS ŪKIO MINISTERIJOS DIREKTORIUS
NACIONALINĖS ŽEMĖS TARNYBOS PRIE ŽEMĖS ŪKIO MINISTERIJOS DIREKTORIAUS Į S A K Y M A S DĖL LIETUVOS ERDVINĖS INFORMACIJOS INFRASTRUKTŪROS METADUOMENŲ REIKALAVIMŲ IR LIETUVOS ERDVINĖS INFORMACIJOS INFRASTRUKTŪROS
Sequence and Structure Alignment Z. Luthey-Schulten, UIUC Pittsburgh, 2006 VMD 1.8.5
Sequence and Structure Alignment Z. Luthey-Schulten, UIUC Pittsburgh, 2006 VMD 1.8.5 Why Look at More Than One Sequence? 1. Multiple Sequence Alignment shows patterns of conservation 2. What and how many
Random Factors in IOI 2005 Test Case Scoring
Informatics in Education, 2006, Vol. 5, No. 1, 5 14 5 2006 Institute of Mathematics and Informatics, Vilnius Random Factors in IOI 2005 Test Case Scoring Gordon CORMACK David R. Cheriton School of Computer
Homology Modeling. Roberto Lins EPFL - summer semester 2005
Homology Modeling Roberto Lins EPFL - summer semester 2005 Disclaimer: course material is mainly taken from: P.E. Bourne & H Weissig, Structural Bioinformatics; C.A. Orengo, D.T. Jones & J.M. Thornton,
Transformation of Lithuania and Ukraine Regional Policy
Inzinerine Ekonomika-Engineering Economics, 2014, 25(3), 350 359 Transformation of Lithuania and Ukraine Regional Policy Zaneta Simanaviciene 1, Akvile Kilijoniene 2, Arturas Simanavicius 3, Illya Khadzhynov
The Minimum Density Power Divergence Approach in Building Robust Regression Models
INFORMATICA, 2011, Vol. 22, No. 1, 43 56 43 2011 Vilnius University The Minimum Density Power Divergence Approach in Building Robust Regression Models Alessandra DURIO, Ennio Davide ISAIA Department of
INFORMACINIŲ GEBöJIMŲ VALDYMAS MOKYKLŲ BIBLIOTEKOSE: KONKREČIŲ ATVEJŲ ANALIZö
Vilniaus universitetas Komunikacijos fakultetas Bibliotekininkyst s ir informacijos mokslų institutas Ingrida Skridailait, Bibliotekų ir informacijos centrų vadybos studijų programos II k. student INFORMACINIŲ
Bioinformatics. Proteins II. - Pattern, Profile, & Structure Database Searching. Robert Latek, Ph.D. Bioinformatics, Biocomputing
Bioinformatics Proteins II. - Pattern, Profile, & Structure Database Searching Robert Latek, Ph.D. Bioinformatics, Biocomputing WIBR Bioinformatics Course, Whitehead Institute, 2002 1 Proteins I.-III.
Theoretical Mechanics Practicums
+ ALEKSANDRAS STULGINSKIS UNIVERSITY Faculty of Agricultural Engineering Department of Mechanics Eglė Jotautienė Theoretical Mechanics Practicums KAUNAS - AKADEMIJA 2012 UDK 629.1:631.374 Eglė Jotautienė
Giri Narasimhan. CAP 5510: Introduction to Bioinformatics. ECS 254; Phone: x3748
CAP 5510: Introduction to Bioinformatics Giri Narasimhan ECS 254; Phone: x3748 giri@cis.fiu.edu www.cis.fiu.edu/~giri/teach/bioinfs07.html 1/23/07 CAP5510 1 Genomic Databases Entrez Portal at National
SMULKAUS IR VIDUTINIO DYDŽIO ĮMONIŲ VIDAUS VALDYMO SISTEMA
KAUNO TECHNOLOGIJOS UNIVERSITETAS INFORMATIKOS FAKULTETAS INFORMACIJOS SISTEMŲ KATEDRA Birutė Kudirkaitė Vaidas Žilionis SMULKAUS IR VIDUTINIO DYDŽIO ĮMONIŲ VIDAUS VALDYMO SISTEMA Magistro darbas Vadovė
THE ASSESSMENT OF THE CELESTIAL BODY INFLUENCE ON THE GEODETIC MEASUREMENTS
VILNIUS GEDIMINAS TECHNICAL UNIVERSITY Darius POPOVAS THE ASSESSMENT OF THE CELESTIAL BODY INFLUENCE ON THE GEODETIC MEASUREMENTS SUMMARY OF DOCTORAL DISSERTATION TECHNOLOGICAL SCIENCES, MEASUREMENT ENGINEERING
A. Žukauskaitė a, R. Plukienė a, A. Plukis a, and D. Ridikas b
Lithuanian Journal of Physics, Vol. 47, No. 1, pp. 97 101 (2007) MODELLING OF NEUTRON AND PHOTON TRANSPORT IN IRON AND CONCRETE RADIATION SHIELDINGS BY THE MONTE CARLO METHOD A. Žukauskaitė a, R. Plukienė
ALL LECTURES IN SB Introduction
1. Introduction 2. Molecular Architecture I 3. Molecular Architecture II 4. Molecular Simulation I 5. Molecular Simulation II 6. Bioinformatics I 7. Bioinformatics II 8. Prediction I 9. Prediction II ALL
Biology Tutorial. Aarti Balasubramani Anusha Bharadwaj Massa Shoura Stefan Giovan
Biology Tutorial Aarti Balasubramani Anusha Bharadwaj Massa Shoura Stefan Giovan Viruses A T4 bacteriophage injecting DNA into a cell. Influenza A virus Electron micrograph of HIV. Cone-shaped cores are
Giri Narasimhan. CAP 5510: Introduction to Bioinformatics CGS 5166: Bioinformatics Tools. Evaluation. Course Homepage.
CAP 5510: Introduction to Bioinformatics CGS 5166: Bioinformatics Tools Giri Narasimhan ECS 389; Phone: x3748 giri@cis.fiu.edu www.cis.fiu.edu/~giri/teach/bioinfs06.html 1/12/06 CAP5510/CGS5166 1 Evaluation
EBI web resources II: Ensembl and InterPro. Yanbin Yin Spring 2013
EBI web resources II: Ensembl and InterPro Yanbin Yin Spring 2013 1 Outline Intro to genome annotation Protein family/domain databases InterPro, Pfam, Superfamily etc. Genome browser Ensembl Hands on Practice
Reklamos internete vartotojų segmentavimas taikant latentinį Dirichlė paskirstymo modelį
Lietuvos matematikos rinkinys ISSN 0132-2818 Lietuvos matematikų draugijos darbai, ser. B www.mii.lt/lmr/ 56 t., 2015, 1 6 Reklamos internete vartotojų segmentavimas taikant latentinį Dirichlė paskirstymo
The investigation of physiological data using the theory of complex systems
Lietuvos matematikos rinkinys ISSN 0132-2818 Proc. of the Lithuanian Mathematical Society, Ser. A Vol. 56, 2015 DOI: 10.15388/LMR.A.2015.02 pages 7 11 The investigation of physiological data using the
THE EIGENVALUE PROBLEM FOR DIFFERENTIAL OPERATOR WITH NONLOCAL INTEGRAL CONDITIONS
VILNIUS GEDIMINAS TECHNICAL UNIVERSITY INSTITUTE OF MATHEMATICS AND INFORMATICS Živil JESEVIČIŪTö THE EIGENVALUE PROBLEM FOR DIFFERENTIAL OPERATOR WITH NONLOCAL INTEGRAL CONDITIONS SUMMARY OF DOCTORAL
DALELIŲ KOMPOZITO DISKRETUSIS MODELIS
VILNIAUS GEDIMINO TECHNIKOS UNIVERSITETAS Vytautas RIMŠA DALELIŲ KOMPOZITO DISKRETUSIS MODELIS DAKTARO DISERTACIJA TECHNOLOGIJOS MOKSLAI, MECHANIKOS INŽINERIJA (09T) Vilnius 2014 Disertacija rengta 2010
VIEŠŲJŲ PASLAUGŲ PERKöLIMO IŠ TRADICINöS Į ELEKTRONINĘ TERPĘ BRANDOS LYGIO VERTINIMAS
VIEŠŲJŲ PASLAUGŲ PERKöLIMO IŠ TRADICINöS Į ELEKTRONINĘ TERPĘ BRANDOS LYGIO VERTINIMAS Egidijus Ostašius Vilniaus Gedimino technikos universitetas Saul tekio al. 11, LT-10223, Vilnius EgidijusOstasius@gama.vtu.lt
Prediction of protein function from sequence analysis
Prediction of protein function from sequence analysis Rita Casadio BIOCOMPUTING GROUP University of Bologna, Italy The omic era Genome Sequencing Projects: Archaea: 74 species In Progress:52 Bacteria:
GIS MOKYMAS LIETUVOS EDUKOLOGIJOS UNIVERSITETE
Geografija ir edukacija. 2015 (3) GIS MOKYMAS LIETUVOS EDUKOLOGIJOS UNIVERSITETE, Lietuvos edukologijos universitetas SANTRAUKA Straipsnyje apžvelgiamas geografinių informacinių sistemų (GIS) mokymas ir
Practical search strategies
Computational and Comparative Genomics Similarity Searching II Practical search strategies Bill Pearson wrp@virginia.edu 1 Protein Evolution and Sequence Similarity Similarity Searching I What is Homology
A general biochemical kinetics data fitting algorithm for quasi-steady-state detection
Lietuvos matematikos rinkinys ISSN 0132-2818 Proc. of the Lithuanian Mathematical Society, Ser. A Vol. 57, 2016 DOI: 10.15388/LMR.A.2016.03 pages 12 17 A general biochemical kinetics data fitting algorithm
A Field Guide. GenBank Records. A Typical GenBank Record GenBank Record: Feature Table. The Flatfile Format. part 2. Header. Feature Table.
A Field Guide part 2 GenBank Records The Flatfile Format Header Feature Table Sequence A Typical GenBank Record GenBank Record: Feature Table LOCUS NM_019570 4279 bp mrna linear ROD 28-OCT-2004 DEFINITION
THE SPRAWL OF VILNIUS CITY ESTABLISHMENT AND ANALYSIS OF GROWING URBAN REGION
ISSN 1822-6701 Annales Geographicae 43 44, 2010 2011 THE SPRAWL OF VILNIUS CITY ESTABLISHMENT AND ANALYSIS OF GROWING URBAN REGION Rūta Ubarevičienė, Donatas Burneika, Edis Kriaučiūnas Nature Research
Bioinformatics. Macromolecular structure
Bioinformatics Macromolecular structure Contents Determination of protein structure Structure databases Secondary structure elements (SSE) Tertiary structure Structure analysis Structure alignment Domain
proteins Estimating quality of template-based protein models by alignment stability Hao Chen 1 and Daisuke Kihara 1,2,3,4 * INTRODUCTION
proteins STRUCTURE O FUNCTION O BIOINFORMATICS Estimating quality of template-based protein models by alignment stability Hao Chen 1 and Daisuke Kihara 1,2,3,4 * 1 Department of Biological Sciences, College
An Introduction to Sequence Similarity ( Homology ) Searching
An Introduction to Sequence Similarity ( Homology ) Searching Gary D. Stormo 1 UNIT 3.1 1 Washington University, School of Medicine, St. Louis, Missouri ABSTRACT Homologous sequences usually have the same,
Optimal Segmentation of Random Sequences
INFORMATICA, 2000, Vol. 11, No. 3, 243 256 243 2000 Institute of Mathematics and Informatics, Vilnius Optimal Segmentation of Random Sequences Antanas LIPEIKA Institute of Mathematics and Informatics Akademijos
Esterio hidrolizės greičio tyrimas.
Laboratorinis darbas Deivis Plaušinaitis Esterio hidrolizės greičio tyrimas. Darbo tikslas. Nustatyti esterio hidrolizės reakcijos greičio konstantą pasirinktoje temperatūroje. Teorinė dalis. Cheminių
Prognosis of radionuclides dispersion and radiological measurements in Lithuania after the accident at Fukushima Daiichi nuclear
Prognosis of radionuclides dispersion and radiological measurements in Lithuania after the accident at Fukushima Daiichi nuclear power plant Rima Ladygienė, Aušra Urbonienė, Auksė Skripkienė, Laima Pilkytė,
DIELECTRIC PROPERTIES OF AURIVILLIUS-TYPE Bi 4-x O 12. Ti 3 CERAMICS
Lithuanian Journal of Physics, Vol 53, No 4, pp 210 214 (2013) Lietuvos mokslų akademija, 2013 DIELECTRIC PROPERTIES OF AURIVILLIUS-TYPE Bi 4-x CERAMICS E Palaimienė a, J Banys a, VA Khomchenko b, and
VILNIUS UNIVERSITY. Alma Molytė INVESTIGATION OF COMBINATIONS OF VECTOR QUANTIZATION METHODS WITH MULTIDIMENSIONAL SCALING
VILNIUS UNIVERSITY Alma Molytė INVESTIGATION OF COMBINATIONS OF VECTOR QUANTIZATION METHODS WITH MULTIDIMENSIONAL SCALING Summary of Doctoral Dissertation Physical Sciences, Informatics (09 P) Vilnius,
KONCENTRACIJOS KAITA STUDENTŲ AUDITORIJOJE
ORO DRĖGNIO, TEMPERATŪROS IR KONCENTRACIJOS KAITA STUDENTŲ AUDITORIJOJE MEASUREMENTS OF RELATIVE HUMIDITY, AIR TEMPERATURE AND CONCENTRATION IN THE UNIVERSITY LECTURE HALL Lina Abaravičiūtė, Genė Šurkienė,