15. LABORATORIJSKA DEJAVNOST MEDICINSKA MIKROBIOLOGIJA / LABORATORY SERVICES MEDICAL MICROBIOLOGY

Transcription

1 15. LAORATORIJSKA DEJAVNOST MEDICINSKA MIOIOLOGIJA / LAORATORY SERVIS MEDICAL MICROIOLOGY 15-0 Uvod Introduction 15-3 Število preiskav, opravljenih v laboratorijih za medicinsko mikrobiologijo v Sloveniji v letu 2001 Number of analyses, performed in microbiology laboratories in Slovenia in the year 2001 Število preiskav, opravljenih v laboratorijih za medicinsko mikrobiologijo v Sloveniji v letu 2002 Number of analyses, performed in microbiology laboratories in Slovenia in the year

2 Zdravstveni statistični letopis LAORATORIJSKA DEJAVNOST MEDICINSKA MIOIOLOGIJA / LAORATORY SERVIS MEDICAL MICROIOLOGY Laboratorijsko dejavnost na področju medicinske mikrobiologije opravljajo laboratoriji Zavodov za zdravstveno varstvo v Mariboru, Celju, Kranju, Novem mestu, Novi Gorici, Kopru in v Murski Soboti, laboratorij Inštituta za varovanje zdravja, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani, laboratoriji v bolnišnicah: laboratorij Splošne bolnišnice dr. Franca ganca v Novi Gorici, laboratorij olnišnice Slovenj Gradec, olnišnice Topolšica, olnišnice v Sežani, laboratorij Kliničnega oddelka za pljučne bolezni in alergije olnišnice, laboratorij matološke klinike (Klinični center, Ljubljana), Zavod za transfuzijsko medicino in laboratorij Mikrolab. Poleg preiskovanja kužnin obsega mikrobiološka laboratorijska dejavnost tudi razvijanje in uvajanje enotne laboratorijske doktrine, delo na področju mikrobiološkega in epidemiološkega spremljanja nalezljivih bolezni ter povzročiteljev, preiskave, ki so v podporo epidemiološkemu raziskovanju, druge raziskave in podobno. V tabel 15-3 prikazujemo število preiskav, opravljenih na različnih kužninah preiskovanih oseb v mikrobioloških laboratorijih v Sloveniji v letih 2001 in Podatke so posredovali predstavniki omenjenih laboratorijev. Medical microbiology laboratory services are provided by the laboratories in the Regional Institutes of Public Health of Maribor, Celje, Kranj, Novo mesto, Nova Gorica, Koper and Murska Sobota, Institute of Public Health of the Republic of Slovenia, Institute of Microbiology and Immunology Faculty of Medicine of the University of Ljubljana, by the laboratories in the following hospitals: General Hospital of dr. Franc ganc in Nova Gorica, hospitals in Slovenj Gradec, Topolšica, Sežana; laboratory of the University Clinic of Respiratory and Allergic Diseases ; laboratory of the Department of matology of the Medical Centre Ljubljana; laboratory of lood Transfusion Centre of Slovenia and by the Microlab laboratory. In addition to specimen examination, work in these laboratories involves the formulation of a uniform laboratory service, microbiological and epidemiological surveillance of communicable diseases and causative agents, analyses to support epidemiological research and other research. The number of analyses, performed on different specimens in the microbiology laboratories in Slovenia in 2001 and 2002 is shown in table The data were provided by the representatives of microbiology laboratories. Legenda sodelujočih laboratorijev: 1. M: Zavod za zdravstveno varstvo Maribor, 2. : Zavod za zdravstveno varstvo Celje, 3. : Zavod za zdravstveno varstvo Kranj, 4. NM: Zavod za zdravstveno varstvo Novo mesto, 5. : Zavod za zdravstveno varstvo Nova Gorica, 6. : Zavod za zdravstveno varstvo Koper, 7. MS: Zavod za zdravstveno varstvo Murska Sobota, 8. IVZ : Inštitut za varovanje zdravja republike Slovenije, Ljubljana, 9. : Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo Medicinske fakultete v Ljubljani, 10. : Klinični oddelek za pljučne bolezni in alergije olnišnice, 11. : Splošna bolnišnica dr. Franca ganca v Novi Gorici, 12. : olnišnica Topolšica, 13. SG: olnišnica Slovenj Gradec, 14. : olnišnica v Sežani, 370

3 15.. Kl.: matološka klinika (Klinični center, Ljubljana), 16. Mikrolab 17. ZTM: Zavod republike Slovenije za transfuzijsko medicino (Laboratorij za ugotavljanje označevalcev okužb za zunanje naročnike) Legend of cooperating laboratories: 1. M: Institute of Public Health, Maribor, 2. : Institute of Public Health, Celje, 3. : Institute of Public Health, Kranj, 4. NM: Institute of Public Health, Novo mesto, 5. : Institute of Public Health, Nova Gorica, 6. : Institute of Public Health, Koper, 7. MS: Institute of Public Health, Murska Sobota, 8. IVZ : Institute of Public Health of the Republic of Slovenia, Ljubljana, 9. : Institute of Microbiology and Immunology Faculty of medicine, University of Ljubljana, 10. : The University Clinic of Respiratory and Allergic Diseases, 11. : General hospital dr. Franca ganca in Nova Gorica, 12. : Hospital Topolšica, 13. SG: Hospital Slovenj Gradec, 14. : Hospital in Sežana, 15.. Kl.: Department of matology, Medical centre Ljubljana and 16. Microlab 17. ZTM: lood transfusion centre of Slovenia (Laboratory for Viral Markers, blood donors not included) Legenda: - Ag: antigen, - ELISA encimsko imunski test (angl.:enzyme-linked immunosorbent assay), - EM elektronska mikroskopija, - ESL laktamaze beta širokega spektra (angl.: extended spectrum beta-lactamases) - HAV hepatitis A virus, - HV hepatitis virus, - HCV hepatitis C virus, - HDV hepatitis D virus, - HEV hepatitis E virus, - HGV hepatitis G virus, - HIV humani virus imunske pomanjkljivosti, - IEM imunska elektronska mikroskopija, - IIF indirektna imunoflorescenca, - KME klopni meningoencefalitis, - MA proti meticilinu odporen Staphylococcus aureus, - NK nukleinska kislina, - RVK reakcija vezave komplementa, - TPHA hemaglutinacijski test za dokaz protiteles proti Treponema pallidum, (angl.: Treponema Pallidum Hemagglutination Assay, - TPPA aglutinacijski test za dokaz protiteles proti T. pallidum, - VDRL aglutinacijski test z lateks delci za določitev protiteles proti T. pallidum (angl. Veneral Disease Research Laboratory ), - VRE proti vankomicinu odporni enterokoki (angl.: vancomycin resistant enterococci) 371

4 Zdravstveni statistični letopis 2002 Legend: - Ag antigen - ELISA Enzyme-Linked Immunosorbent Assay, - EM Electron Microscopy, - ESL Extended Spectrum eta-lactamases, - HAV Hepatitis A Virus, - HV Hepatitis Virus, - HCV Hepatitis C Virus, - HDV Hepatitis D Virus, - HEV Hepatitis E Virus, - HGV Hepatitis G Virus, - HIV Human Immunodeficiency Virus, - IEM Immune Electron Microscopy, - IIF Indirect Immunofluorescence Test, - KME Tick borne meningoencephalitis, - MA Meticillin Resistant Staphylococcus aureus, - NA Nucleic Acid, - RVK Complement Fixation Test, - TPHA Treponema Pallidum Hemagglutination Assay, - TPPA Treponema Pallidum Particle Agglutination - VDRL Veneral Disease Research Laboratory, - VRE Vancomycin Resistant Enterococci. Opombe in pojasnila k tabelam: - (1): opomba 1: Ena preiskava vključuje: neposredno mikroskopsko preiskavo iz kužnine in/ali preiskavo na aerobne bakterije in/ali preiskavo na anaerobne bakterije iz istega vzorca. - (2): opomba 2: rez mikobakterij in znotrajceličnih bakterij: klamidij mikoplazem, in legionel. - (3): opomba 3: Štejemo ciljane preiskave samo na glive: kvasovke in vlaknate glive. - (4): opomba 4: Pri seroloških preiskavah štejemo število vzorcev, poslanih na določeno preiskavo; ne glede na to, koliko vrst Ig smo določili (morebitno preiskavo na IgA, IgG, IgM, opravljeno z isto metodo, npr. IIF, štejemo kot eno preiskavo). - (5): opomba 5: Vključene so preiskave: ELISA, IIF, RVK in druge. Če je en vzorec poslan na npr. ELISA in IIF, štejemo to kot 2 preiskavi. -»Hemokulture«: Če je poslan par stekleničk (aerobna in anaerobna) je šteta ena preiskava, enako se šteje ena preiskava, če je poslana le ena steklenička. -»Kužnine iz spodnjih dihal«vključujejo: izmeček, aspirat iz spodnjih dihal, AL, mini AL, tkivo, odvzeto ob bronhialni biopsiji in podobno. -»Kužnine iz prebavil (blato, bris rektuma, žolč idr): preiskave na bakterije razen mikobakterij in «: če je blato poslano na koprokulturo (»na patogene črevesne bakterije«), štejemo po eno preiskavo na salmonele in šigele, na kampilobaker, na jersinijo in na črevesne ešerihije. -»Kužnine iz prebavil (blato idr) na viruse«: rotaviruse, adenoviruse, astroviruse, kaliciviruse, koronaviruse in druge viruse iz prebavil. -»Urin, urin na komercialnem gojišču«: - urin na Sanford, na urinokulturo, (ne vključuje preiskav na klamidije, legionele in mikoplazme). - urin na komercialnem gojišču za identificiranje bakterij. - urin iz katetra (stalnega, enkratna kateterizacija). - izpirek iz mehurja. 372

5 -»Kužnine iz kože, ran, abscesov in podobno«: kužnine, odvzete iz površine kože, razen nadzornih kužnin, vzorci površinskih in globokih ran ter razjed (razjeda pri diabetičnem stopalu, preležanina) pustul, petehij, aken, izpuščajev in drugih kožnih sprememb, bris izstopišča katetra, kužnine iz poškodbenih ran, operacijskih ran, ugriznin, abscesov, hematomov, fistul in podobno. -»Kužnine iz sečil in spolovil (razen urinov)«: kužnine iz zunanjega spolovila, iz nožnice, maternice, bris uretre in podobno. -»Katetri«: dializni, intravenski, razen urinskega. - preiskava na MA: če je vzorec npr. iz rane poslan na patogene bakterije in na MA, štejemo 1 preiskavo»kužnine iz kože, ran, abscesov.«ter 1 preiskavo»nadzorne kužnine na MA). - Ostali povzročitelji virusnih hepatitisov: HAV, HCV, HDV, HEV, HGV. - NM: V letu 2001 nadzornih kužnin na MA niso posebej evidentirali. - NM: V letu 2001 in 2002 seroloških preiskav na povzročitelja Toksoplasma Gondii - ELISA IgG avidnost niso posebej evidentirali. Remarks and explanations of the tables: - (1): one analysis includes: direct microscopic examination from specimen and/or examination for the presence of aerobic bacteria and/or examination for the presence of anaerobic bacteria from the same specimen, - (2): without mycobacteria and intracellular bacteria: chlamydia, mycoplasmas and legionellae, - (3): only analyses targeted on the presence of fungi are included, - (4): serological analyses: included are samples submitted for a specific examination, irrespective of the number of antibodies determined (examination for IgA, IgG, IgM antibodies, performed with the same method, counts as one analysis), - (5): ELISA, IIF, Complement fixation test and other tests are included. For example: if one specimen is examined with ELISA and IIF, this counts for two analyses; - lood cultures: one analysis counts for one pair of bottles (aerobic and anaerobic) and similar; one analysis is counted if only one bottle was sent; -»Lower respiratory tract specimens«: sputum, tracheal aspirate, AL, minial, bronchial bioptic specimens and similar specimens are included, -»gastrointestinal tract specimens for bacteria (stool, rectal swab, bile, etc.)«: if the specimen is sent to pathogenic bacteria, one analysis for each examination: (1) salmonella and shigella, (2) campylobacter, (3) yersinia and (4) intestinal escherichia is counted, -»gastrointestinal tract specimens for viruses«: rotavirus, adenovirus, astrovirus, calicivirus, coronavirus etc. are included, -»Urine, urine on commercial medium«: - Quantitative urine examination (Sanford), urine culture, etc. (without chlamydia, mycoplasmas and legionellae), - acterial isolation and identification from a commercial medium for culture and enumeration of urinary bacteria (Uricult, Uriline and similar), -»Specimens of skin, wounds, abscesses and similar«: specimens from the surface of the skin except specimens of superficial wounds, ulcers, deep wounds, post-operative wounds, petechia, human and animal bite wounds, etc. -»Urinary tract specimens (other than urine) and genital specimens» include: specimens from external genitalia, vagina, uterus, urethral swabs, etc., -»Catheters«: endovenus, subclavic and dialysis catheters (without urine catheters), - examination for the presence of MA: if one specimen is sent, for example, to MA examination and to pathogenic bacteria: two analyses are counted: one sent to MA and one to Specimens of skin, wounds bacteria, - other viruses causing hepatitis: Hepatitis A virus, Hepatitis C virus, Hepatitis D virus, Hepatitis E virus, Hepatitis G virus. - NM: In 2001 screening specimens for MA were not recorded separately. - NM: In 2001 and 2002 serological analyses for Toxoplasma Gondii - ELISA IgG avidity were not recorded separately. 373

6 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Kri hemokultura na bakterije (1, 2) bacteria (1,2) lood - blood culture fungi (3) Likvor Cerebrospinal fluid na bakterije (1, 2) in antigene bacteria (1, 2) and bacterial antigens Druga tkiva in organi na bakterije (1, 2) bacteria (1,2) Other tissues and organs fungi (3) Kužnine iz spodnjih dihal Lower respiratory tract specimens Kužnine iz zgornjih dihal in ustne votline Upper respiratory tract and oral cavity specimens Kužnine iz zgornjih dihal Upper respiratory tract specimens na bakterije (1, 2) bacteria (1, 2) fungi (3) na bakterije (2) bacteria (2) na bakterije pri osebah pod zdr. nadzorom bacteria, specimens from persons under health surveillance fungi (3)

7 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI detecting the presence of: M NM MS IVZ SG na salmonele, šigele Salmonella, Shigella Kužnine iz prebavil (blato, bris rektuma, žolč idr) Gastrointestinal tract specimens (stool, rectal swab, bile, etc.) Kužnine iz prebavil (blato) Gastrointestinal tract specimens (stool) Urin, urin na komercialnem gojišču Urine, urine on commercial medium na kampilobakter Campylobacter na jersinijo Yersinia na črevesne ešerihije intestinal Escherichia na redke bakterijske povzročitelje okužb uncommon cousative bacteria na Clostridium difficile-kultura Clostridium difficile - culture na C.difficile - antigen, toksin C. difficile - antigen, toxin na Helicobacter pylori - antigen Helicobacter pylori-ag fungi (3) na bakterije pri osebah pod zdr. nadzorom bacteria, specimens from persons under health surveillance Sanford, urinokultura, izolacija bakterij iz komerc. gojišča (Urikult, Uriline in podobno), (2) Quantitative urine examination (Sanford), urine culture, bacterial isolation from a commercial medium (Uricult, Uriline and similar), (2) fungi (3)

8 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Kužnine iz kože, ran, abscesov in podobno Specimens of skin, wounds, abscesses and similar Kožne luske, lasje, dlake, nohti Skin scales, hair, bristles, nails Kužnine iz sečil in spolovil (razen urinov) Urinary tract specimens (other than urine), genital specimens na bakterije (1, 2) bacteria (1,2) fungi (3) fungi (3) na bakterije (2) bacteria (2) fungi (3) Katetri, dreni na bakterije (2) bacteria (2) Catheters, drains fungi (3) Kužnine iz očesa Eye specimens na bakterije (2) bacteria (2) Kužnine iz ušesa na bakterije (2) bacteria (2) Ear specimens fungi (3)

9 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Nadzorne kužnine (nos, žrelo, koža in drugo) Screening specimens (nose, throat, skin and others) na MA MA na MA in ostale večkratno odporne bakterije MA and other multiresistant bacteria ostale preiskave (brez MA, npr. ESL sevi, VRE ipd) other analyses (without MA, eg. ESL strains, VRE, etc.)

10 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA PARAZITE ANALYSES FOR THE PRESEN OF PARASITES detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Kužnine iz prebavil (blato, idr) Gastrointestinal tract specimens (stool, etc.) Ostale kužnine Other specimens Kužnine iz prebavil (blato) Gastrointestinal tract specimens (stool) na parazite pri osebah pod zdr. nadzorom parasites, specimens from persons under health surveillance na parazite parasites na parazite parasites PREISKAVE NA ZNOTRAJLIČNE AKTERIJE (KLAMIDIJE, MIKOPLAZME IN LEGIONELE) ANALYSES FOR THE PRESEN OF INTRALLULAR ACTERIA (CHLAMYDIA, MYCOPLASMAS, LEGIONELLAE) detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Različne kužnine Different specimens Različne kužnine Different specimens na Chlamydia trachomatis - izolacija Chlamydia trachomatis - isolation na C. trachomatis - dokaz Ag C.trachomatis - Ag na C. trachomatis - dokaz NK C. trachomatis - NA na Chlamydia pneumonia izolacija Chlamydia pneumoniae - isolation na C. pneumoniae - dokaz Ag C. pneumoniae - Ag na C. pneumoniae - dokaz NK C. pneumoniae - NA

11 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA ZNOTRAJLIČNE AKTERIJE (KLAMIDIJE, MIKOPLAZME IN LEGIONELE) ANALYSES FOR THE PRESEN OF INTRALLULAR ACTERIA (CHLAMYDIA, MYCOPLASMAS, LEGIONELLAE) detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Različne kužnine Different specimens Različne kužnine Different specimens na mikoplazme izolacija Mycoplasmas - isolation na mikoplazme - dokaz Ag Mycoplasmas - Ag na mikoplazme - dokaz NK Mycoplasmas- NA na legionele izolacija Legionellae - isolation na legionele - dokaz Ag (ELISA, IIF) Legionellae - Ag (ELISA, IIF) na legionele - dokaz NK Legionellae - NA

12 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA VIRUSE ANALYSES FOR THE PRESEN OF VIRUSES detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Kužnine iz primarno sterilnih mest (likvor, kri, izlivi: abdom., plevr., tkiva: bezgavke idr) Specimens from sterile sites (cerebrospinal fluid, blood, exudates: abdom., plevr., tissues: lymphatic glands, etc.) viruses - isolation na viruse (EM, IEM) viruses (EM, IEM) na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - Na Kužnine iz spodnjih dihal Lower respiratory tract specimens Kužnine iz zgornjih dihal in ustne votline Upper respiratory tract and oral cavity specimens viruses - isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA viruses - isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA

13 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA VIRUSE ANALYSES FOR THE PRESEN OF VIRUSES detecting the presence of: M NM MS IVZ SG viruses - isolation Kužnine iz prebavil (blato, idr) Gastrointestinal tract specimens (stool, etc.) na viruse (EM, IEM) viruses (EM, IEM) na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA Kužnine iz očesa Eye specimens Kužnine iz sečil, spolovil in urin Urinary tract specimens (urine, urogenital specimens, etc.) viruses - isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA viruses -isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA viruses - isolation Kužnine iz kožnih lezij, vsebina mehurčkov itd. Specimens from skin lesions, blister contents, etc. na viruse (EM, IEM) viruses (EM, IEM) na viruse -dokaz Ag viruses - Ag na viruse-dokaz NK viruses - NA Kužnine iz prebavil (blato) Gastrointestinal tract specimens (stool) na viruse - pri osebah pod zdr. nadzorom viruses - specimens from persons under health surveillance

14 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 PREISKAVE NA MIKOAKTERIJE ANALYSES FOR THE PRESEN OF MYCOACTERIA detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Kužnine iz primarno sterilnih mest (likvor, kri, izlivi: abdom., plevr. idr., tkiva: bezgavke idr) Specimens from sterile sites (cerebrospinal fliud, blood, exudates: abdom., plevr., tissues: lymphatic glands, etc.) Kužnine iz zgornjih in spodnjih dihal Respiratory tract specimens Ostale kužnine (razen iz dihal in primarno sterilnih mest) Other specimens (without respiratory tract and steril sites specimens) na mikobakterije mikroskopska preiskava Mycobacteria - microscopic examination na mikobakterije - izolacija Mycobacteria - isolation na mikobakterije - dokaz NK Mycobacteria -- NA na mikobakterije - mikroskopska preiskava Mycobacteria - microscopic examination na mikobakterije - izolacija Mycobacteria - isolation na mikobakterije - dokaz NK Mycobacteria - NA na mikobakterije - mikroskopska preiskava Mycobacteria - microscopic examination na mikobakterije - izolacija Mycobacteria - isolation na mikobakterije - dokaz NK Mycobacteria -- NA

15 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 SEROLOGIJA SEROLOGY Serological analyses M NM MS IVZ SG orelije ELISA (4) orrelia - ELISA ( 4) orelije IIF (4) orrelia - IIF (4) orelije - Western blot orrelia - Western blot T. pallidum TPPA T. pallidum TPHA T. pallidum - VDRL T. pallidum - ELISA Mikoplazme (5) Mycoplasmas (5) C. trachomatis, C. peumoniae, C. psittaci (5) Kri serum in druge kužnine (likvor, idr) za dokazovanje protiteles lood - serum and other specimens (cerebrospinal fluid, etc.) for antibody Legionele (5) Legionellae (5) Toksoplasma Gondii - ELISA IgG avidnost Toxoplasma Gondii - ELISA IgG avidity T. Gondii - ELISA (4) T. Gondii IgG IIF (4) ostali paraziti - določanje protiteles (4, 5) other parasites - antibody (4, 5) Hepatitis virus določanje protiteles (4) Hepatitis virus - antibody (4) Hepatitis virus - dokaz antigenov Hepatitis virus - antigen

16 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2001 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2001 SEROLOGIJA SEROLOGY Serological analyses M NM MS IVZ SG Ostali povzročitelji virusnih hepatitisov (razen HV) - določanje protiteles (4) Hepatitis viruses (other than HV) - antibody (4) Ostali povzročitelji virusnih hepatitisov (razen HV) - določanje Ag Hepatitis viruses (other than HV) - antigen (4) Kri serum in druge kužnine (likvor, idr) za dokazovanje protiteles lood - serum and other specimens (cerebrospinal fluid, etc.) for antibody Ostali povzročitelji virusnih hepatitisov (razen HV) - določanje NK Hepatitis viruses (other than HV) - NA HIV 1/2/0 protitelesa presejalni test ELISA HIV - 1/2/0 - antibody - screening test - ELISA HIV 1 ali 2 potrditveni test (Western blot, Imunoblot) HIV - 1 ali 2 confirmatory tests (Western blot, Imunoblot) KME (4,5) Tick - born meningoencephalitis (4, 5) Virusna serologija razen HIV, virusnih hepatitisov in KME (4, 5) Serological tests for viruses other than tests for HIV, Hepatitis viruses and Tick - born meningoencephalitis (4,5) Helicobacter pylori serologija Helicobacter pylori serology

17 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI Kri hemokultura lood - blood culture Likvor Cerebrospinal fluid detecting the presence of: M NM MS IVZ SG na bakterije (1,2) bacteria (1,2) fungi (3) na bakterije (1,2) in antigene bacteria (1, 2) and bacterial antigens Druga tkiva in na bakterije (1,2) bacteria (1,2) organi Other tissues and organs fungi (3) Kužnine iz spodnjih dihal Lower respiratory tract specimens Kužnine iz zgornjih dihal in ustne votline Upper respiratory tract and oral cavity specimens Kužnine iz zgornjih dihal Upper respiratory tract specimens na bakterije (1,2) bacteria (1, 2) fungi (3) na bakterije (2) bacteria (2) fungi (3) na bakterije pri osebah pod zdr. nadzorom bacteria, specimens from persons under health surveillance

18 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI Kužnine iz prebavil (blato, bris rektuma, žolč idr) Gastrointestinal tract specimens (stool, rectal swab, bile, etc.) Kužnine iz prebavil (blato) Gastrointestinal tract specimens (stool) detecting the presence of: M NM MS IVZ SG na salmonele, šigele Salmonella, Shigella na kampilobakter Campylobacter na jersinijo Yersinia na črevesne ešerihije intestinal Escherichia na redke bakterijske povzročitelje okužb uncommon cousative bacteria na Clostridium difficilekultura Clostridium difficile - culture na C.difficile - antigen, toksin C. difficile - antigen, toxin na Helicobacter pylori - antigen na Helicobacter pylori-ag fungi (3) na bakterije pri osebah pod zdr. nadzorom bacteria, specimens from persons under health surveillance

19 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI Urin, urin na komercialnem gojišču Urine, urine on commercial medium Kužnine iz kože, ran, abscesov in podobno Specimens of skin, wounds, abscesses and simillar Kožne luske, lasje, dlake, nohti Skin scales, hair, bristles, nails Kužnine iz sečil in spolovil (razen urinov) Urinary tract specimens (other than urine), genital specimens detecting the presence of: Sanford, urinokultura, izolacija bakterij iz komerc. gojišča (Urikult, Uriline in podobno), (2) Quantitative urine examination (Sanford), urine culture, bacterial isolation from a commercial medium (Uricult, Uriline and simillar), (2) M NM MS IVZ SG fungi (3) na bakterije (1,2) bacteria (1,2) fungi (3) fungi (3) na bakterije (2) bacteria (2) fungi (3) Katetri, dreni na bakterije (2) bacteria (2) Catheters, drains fungi (3) Kužnine iz očesa Eye specimens na bakterije (2) bacteria (2) Kužnine iz ušesa na bakterije (2) bacteria (2) Ear specimens fungi (3)

20 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA AKTERIJE (REZ MIKOAKTERIJ IN ZNOTRAJLIČNIH AKTERIJ) IN GLIVE ANALYSES FOR THE PRESEN OF ACTERIA (WITHOUT MYCOACTERIA AND INTRALLULAR ACTERIA) AND FUI Nadzorne kužnine (nos, žrelo, koža in drugo) - Screening specimens (nose, throat, skin and others) detecting the presence of: na MA MA na MA in ostale večkratno odporne bakterije MA and other multiresistant bacteria ostale preiskave (brez MA, npr. ESL sevi, VRE ipd) other tests (without MA, eg. ESL strains, VRE, etc.) M NM MS IVZ SG PREISKAVE NA PARAZITE ANALYSES FOR THE PRESEN OF PARASITES Kužnine iz prebavil (blato, idr) Gastrointestinal tract specimens (stool, etc.) Ostale kužnine Other specimens detecting the presence of: na parazite parasites M NM MS IVZ SG na parazite parasites Kužnine iz prebavil (blato) Gastrointestinal tract specimens (stool) na parazite pri osebah pod zdr. nadzorom parasites, specimens from persons under health surveillance

21 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA ZNOTRAJLIČNE AKTERIJE (KLAMIDIJE, MIKOPLAZME IN LEGIONELE) ANALYSES FOR THE PRESEN OF INTRALLULAR ACTERIA (CHLAMYDIA, MYCOPLASMAS, LEGIONELLAE) detecting the presence of: M NM MS IVZ SG Različne kužnine Different specimens Različne kužnine Different specimens Različne kužnine Different specimens na Chlamidia trachomatis - izolacija Chlamidia trachomatis isolation na C. trachomatis - dokaz Ag C.trachomatis - Ag na C. trachomatis - dokaz NK C. trachomatis - NA na Chlamidia pneumoniae izolacija Chlamidia pneumoniae isolation na C. pneumoniae - dokaz Ag C. pneumoniae - Ag na C. pneumoniae - dokaz NK C. pneumoniae - NA na mikoplazme izolacija Mycoplasmas - isolation na mikoplazme - dokaz Ag Mycoplasmas - Ag na mikoplazme - dokaz NK Mycoplasmas- NA na legionele izolacija Legionellae - isolation Različne kužnine Different specimens na legionele - dokaz Ag (ELISA, IIF) Legionellae - Ag (ELISA, IIF) na legionele - dokaz NK Legionellae - NA

22 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA VIRUSE ANALYSES FOR THE PRESEN OF VIRUSES Kužnine iz primarno sterilnih mest (likvor, kri, izlivi: abdom., plevr., tkiva: bezgavke idr) Specimens from sterile sites (cerebrospinal fliud, blood, exudates: abdom., plevr., tissues: lymphatic glands, etc.) Kužnine iz spodnjih dihal Lower respiratory tract specimens Kužnine iz zgornjih dihal in ustne votline Upper respiratory tract and oral cavity specimens detecting the presence of: M NM MS IVZ SG viruses - isolation na viruse (EM, IEM) viruses (EM, IEM) na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - Na viruses - isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA viruses - isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA viruses - isolation Kužnine iz prebavil (blato, idr) Gastrointestinal tract specimens (stool, etc.) na viruse (EM, IEM) viruses (EM, IEM) na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA

23 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA VIRUSE ANALYSES FOR THE PRESEN OF VIRUSES Kužnine iz očesa Eye specimens Kužnine iz sečil, spolovil in urin Urinary tract specimens (urine, urogenital specimens, etc.) Kužnine iz kožnih lezij, vsebina mehurčkov itd. Specimens taken from skin lesions, blister contents, etc. detecting the presence of: M NM MS IVZ SG viruses - isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA viruses -isolation na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse - dokaz NK viruses - NA viruses - isolation na viruse (EM, IEM) viruses (EM, IEM) na viruse - dokaz Ag viruses - Ag na viruse-dokaz NK viruses - NA Kužnine iz prebavil (blato) Gastrointestinal tract specimens (stool) na viruse - pri osebah pod zdr. nadzorom viruses - specimens from persons under health surveillance

24 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 PREISKAVE NA MIKOAKTERIJE ANALYSES FOR THE PRESEN OF MYCOACTERIA Kužnine iz primarno sterilnih mest (likvor, kri, izlivi: abdom., plevr. idr., tkiva: bezgavke idr.) Specimens from sterile sites (cerebrospinal fliud, blood, exudates: abdom., plevr., tissues: lymphatic glands, etc.) Kužnine iz zgornjih in spodnjih dihal Respiratory Tract Specimens detecting the presence of: na mikobakterije mikroskopska preiskava Mycobacteria - microscopic examination na mikobakterije - izolacija Mycobacteria - isolation M NM MS IVZ SG na mikobakterije - dokaz NK Mycobacteria -- NA na mikobakterije - mikroskopska preiskava Mycobacteria - microscopic examination Ostale kužnine (razen iz dihal in primarno sterilnih mest) Other specimens (without respiratory tract and steril sites specimens) na mikobakterije - izolacija Mycobacteria - isolation na mikobakterije - dokaz NK Mycobacteria -- NA na mikobakterije - mikroskopska preiskava Mycobacteria - microscopic examination na mikobakterije - izolacija Mycobacteria - isolation na mikobakterije - dokaz NK Mycobacteria -- NA

25 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 SEROLOGIJA SEROLOGY Serological analyses M NM MS IVZ SG orelije ELISA (4) orrelia - ELISA ( 4) orelije IIF (4) orrelia - IIF (4) orelije - Western blot orrelia - Western blot T. pallidum TPPA Kri serum in druge kužnine (likvor, idr) za dokazovanje protiteles lood - serum and other specimens (cerebrospinal fluid, etc.) for antibody T. pallidum TPHA T. pallidum - VDRL T. pallidum - ELISA Mikoplazme (5) Mycoplasmas (5) C. trachomatis, C. peumoniae, C. psittaci (5) Legionele (5) Legionellae (5) Toksoplazma Gondii - ELISA IgG avidnost Toxoplasma Gondii - ELISA IgG avidity T. Gondii - ELISA (4)

26 Zdravstveni statistični letopis ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 SEROLOGIJA SEROLOGY Serological analyses M NM MS IVZ SG T. Gondii IgG IIF (4) Kri serum in druge kužnine (likvor, idr) za dokazovanje protiteles lood - serum and other specimens (cerebrospinal fluid, etc.) for antibody ostali paraziti določanje protiteles (4, 5) other parasites - antibody (4, 5) Hepatitis virus določanje protiteles (4) Hepatitis virus - antibody (4) Hepatitis virus - dokaz antigenov Hepatitis virus - antigen Ostali povzročitelji virusnih hepatitisov (razen HV) - določanje protiteles (4) Hepatitis viruses (other than HV) - antibody (4) Ostali povzročitelji virusnih hepatitisov (razen HV) - določanje Ag Hepatitis viruses (other than HV) - antigen (4) Ostali povzročitelji virusnih hepatitisov (razen HV) - določanje NK Hepatitis viruses (other than HV) - NA HIV 1/2/0 protitelesa presejalni test ELISA HIV - 1/2/0 - antibody - screening tests - ELISA

27 15-3 ŠTEVILO PREISKAV, OPRAVLJENIH V LAORATORIJIH ZA MEDICINSKO MIOIOLOGIJO V SLOVENIJI V LETU 2002 NUMER OF ANALYSES, PERFORMED IN MICROIOLOGY LAORATORIES IN SLOVENIA IN THE YEAR 2002 SEROLOGIJA SEROLOGY SEROLOGY Kri serum in druge kužnine (likvor, idr) za dokazovanje protiteles lood - serum and other specimens (cerebrospinal fluid, etc.) for antibody detecting the presence of: HIV 1 ali 2 potrditveni test (Western blot,imunoblot) - HIV - 1 ali 2 confirmatory tests (Western blot, Imunoblot) KME (4, 5) Tick - borne meninghoencephalitis (4, 5) Virusna serologija razen HIV, virusnih hepatitisov in KME (4, 5) Serological tests for viruses other than tests for HIV, Hepatitis viruses and Tick - borne meningoencephalitis (4, 5) Helicobacte pylori serologija Helicobacter pylori serology M NM MS IVZ SG