Fukui K, Kuramitsu S (2013) Simultaneous use of MutS and RecA for suppression of nonspecific amplification during PCR. J Nucleic Acid ID

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1 各研究室発表論文 2013 原著 総説 ( 年号の後にR と付記 ) 著書( 同 B と付記 ) の3 項目に分けて掲載し 同研究室 グループ内では著者姓のABC 順に配列した * は研究室間共同研究論文で重出 下線は当該研究室教職員 生体分子機能学研究室 ( 倉光研 ) Agari Y, Sakamoto K, Yutani K, Kuramitsu S, Shinkai A (2013) Structure and function of a TetR family transcriptional regulator, SbtR, from Thermus thermophilus HB8. Proteins 81: Asada Y, Sugahara M, Mizutani H, Naitow H, Tanaka T, Matsuura Y, Agari Y, Ebihara A, Shinkai A, Kuramitsu S, Yokoyama S, Kaminuma E, Kobayashi N, Nishikata K, Shinoyama S, Toyoda T, Ishikawa T, Kunishima N (2013) Integrated data base of information from structural genomics experiment. Acta Crystallogr D 69: Devi AS, Ebihara A, Kuramitsu S, Yokoyama S, Kurarevel T, Pouunraji K (2013) Crystal structure of type I 3-dehydroquinqte dehydratase of Aquifex aeolicus suggests closing of active site Flap is not essential for enzyme action. Biochem Biophys Res Commun 432: Fukui K, Bessho Y, Shimada A, Yokoyama S, Kuramitsu S (2013) Thermostable mismatch-recognizing protein MutS suppresses nonspecific amplification during PCR. Int J Mol Sci 14: Fukui K, Kuramitsu S (2013) Simultaneous use of MutS and RecA for suppression of nonspecific amplification during PCR. J Nucleic Acid ID Okanishi H, Kim K, Masui R, Kuramitsu S (2013) Acetylome with structural mapping reveals the significance of lysine acetylation in Thermus thermophilus. J Proteome Res 12: Ouchi T, Tomita T, Horie A, Yoshita A, Takahashi K, Nishida H, Lassak K, Taka H, Mineki R, Fujimura T, Kosono S, Nishiyama C, Masui R, Kuramitsu S, Alberts SJ, Kuzuyama T, Nishiyama M (2013) Lysine and arginine biosyntheses mediated by a common carrier protein in Sulfolobus. Nature Chem Biol 9: Ragunathan P, Raghunath G, Kuramitsu S, Yokoyama S, Kumarevel T, Ponnuraj K (2013) Crystallization, characterization and preliminary X-ray crystallographic analysis of GK2848, A putative carbonic anhydrase of Geobacillus kaustophilus. Acta Crystallogr F 69:

2 Sampei G, Kanagawa M, Baba S, Shimasaki T, Taka H, Mitsui S, Fujiwara S, Yanagida Y, Kusano M, Suzuki S, Terao K, Kawai H, Fukai Y, Nakagawa N, Ebihara A, Kuramitsu S, Yokoyama S, Kawai G (2013) Structures and reaction mechanisms of the two related enzymes, PurN and PurU. J Biochem 154: *Shimada A, Kawasoe Y, Hata Y, Takahashi TS, Masui R, Kuramitsu S, Fukui K (2013) MutS stimulates the endonuclease activity of MutL in an ATP-hydrolysis-dependent manner. FEBS J 280: Tomoike F, Kuramitsu S, Masui R (2013) Unique substrate specificity of purine nucleoside phosphorylases from Thermus thermophilus. Extremophiles 17: Uemura Y, Nakagawa N, Wakamatsu T, Kim K, Montelione GT, Hunt JF, Kuramitsu S, Masui R (2013) Crystal structure of the ligand-binding form of nanornase from Bacteroides fragilis, a member of the DHH/DHHA1 phosphoesterase family of proteins. FEBS Lett 587: 分子遺伝学研究室 ( 升方研 ) Nanbu T, Takahashi K, Murray IM, Hirata N, Ukimori S, Kanke M, Masukata H, Yukawa M, Tsuchiya E, Ueno M (2013) Fission yeast RecQ helicase Rqh1 is required for the maintenance of circular chromosomes. Mol Cell Biol 33: *Shimada A, Kawasoe Y, Hata Y, Takahashi TS, Masui R, Kuramitsu S, Fukui K (2013) MutS stimulates the endonuclease activity of MutL in an ATP-hydrolysis-dependent manner. FEBS J 280: 神経可塑性生理学研究室 ( 小倉研 ) Oe Y, Tominaga-Yoshino K, Hasegawa S, Ogura A (2013) Dendritic spine dynamics in synaptogenesis after repeated LTP inductions: Dependence on pre-existing spine density. Sci Rep 3: Sakuragi S, Tominaga-Yoshino K, Ogura A (2013) Involvement of TrkB- and p75 NTR -signaling pathways in two contrasting forms of long-lasting synaptic plasticity. Sci Rep 3: 冨永恵子, 小倉明彦 (2013R) 長期記憶の細胞機構解明を目指して. 日薬理誌 142: 小倉明彦 (2013B) 時空間記憶と夢の仮説. 芸術と脳 近藤寿人編. p54-77, 大阪大学出版会 ( 阪大リーブル 42)333pp. 細胞内情報伝達研究室 ( 河村研 ) Sato S, Fukagawa T, Tachibanaki S, Yamano Y, Wada A, Kawamura S (2013) Substrate

3 specificity and subcellular localization of the aldehyde-alcohol redox-coupling reaction in carp cones. J Biol Chem 288: Tsutsui K, Tachibanaki S, Shimauchi-Matsukawa Y, Shichida Y, Kawamura S (2013) Different phosphorylation rates among vertebrate cone visual pigments with different spectral sensitivities. Biochem Biophys Res Commun 440: 発生生物学研究室 ( 西田研 ) Omotezako T, Nishino A, Onuma TA, Nishida H (2013) RNA interference in the appendicularian Oikopleura dioica reveals the function of the Brachyury gene. Dev Genes Evol 223: 小沼健 (2013R) ゼブラフィッシュの Kiss1 受容体の重複遺伝子が示す 発現とリガンド選択性の多様性 および 転写促進活性をもつ核局在バリアントの存在. 比較内分泌学 148: 植物生長生理学研究室 ( 柿本研 ) Jewaria PK, Hara T, Tanaka H, Kondo T, Betsuyaku S, Sawa S, Sakagami Y Aimoto S, Kakimoto T (2013) Differential effects of the peptides stomagen, EPF1 and EPF2 on activation of MAP kinase MPK6 and the SPCH protein level. Plant Cell Physiol 54: Takada S (2013) Post-embryonic induction of ATML1-SRDX alters the morphology of seedlings. PLoS ONE 8:e Takada S, Takada N, Yoshida A (2013) Induction of epidermal cell fate in Arabidopsis shoots. Plant Signal Behav 8:e Takada S, Takada N, Yoshida A (2013) ATML1 promotes epidermal cell differentiation in Arabidopsis shoots. Development 140: Tanaka H, Kitakura S, Rakusova H, Uemura T, Feraru MI, De Ricke R, Robert S, Kakimoto T, Friml J (2013) Cell polarity and patterning by PIN trafficking through early endosomal compartments in Arabidopsis thaliana. PLoS Genet 9:e Xing Q, Creff A, Waters A, Tanaka H, Goodrich J, Ingram G (2013) ZHOUPI controls embryonic cuticle formation via a signalling pathway involving the subtilisin protease ABNORMAL LEAF-SHAPE1 and the receptor kinases GASSHO1 and GASSHO2. Development 140: 核機能学研究室 ( 滝澤研 ) Tanaka S, Komeda Y, Umemori T, Kubota Y, Takisawa H, Araki H. (2013) Efficient initiation

4 of DNA replication in eukaryotes requires Dpb11/TopBP1-GINS interaction. Mol Cell Biol 33: 分子生物学 教育研究室 ( 米崎研 ) Wei Y, Gao ZQ, Otsuka Y, NakaK, Yonesaki T, Zhang H, Dong YH (2013) Structure-function studies of Escherichia coli RnlA reveal a novel toxin structure involved in bacteriophage resistance. Mol Microbiol 90: 細胞生物学研究室 ( 松野研 ) Aoyama N, Yamakawa T, Sasamura T, Yoshida Y, Ohori M, Okubo H, Iida E, Sasaki N, Ueda R, Matsuno K (2013) Loss- and gain-of function analyses of vacuolar protein sorting 2 in Notch signaling of Drosophila melanogaster. Genes Genet Syst 88: Nakamura M, Matsumoto K, Iwamoto Y, Muguruma T, Nakazawa N, Hatori R, Taniguchi K, Maeda R, Matsuno K (2013) Reduced cell number in the hindgur epithelium disrupts hindgut left-right asymmetry in a mutant of pebble, encoding a RhoGEF, in Drosophila embryo. Mech Dev 130: Sasamura T, Matsuno K, Fortini ME (2013) Disruption of Drosophila melanogaster lipid metabolism genes causes tissue overgrowth associated with developmental signaling. PLoS Genet 9:e 分子生物学研究室 ( 上田研 ) Kuwayama H, Miyanaga Y, Urushihara H, Ueda M (2013) RabGAP regulates life-cycle duration via trimeric G-protein cascades in Dictyostelium discoideum. PLoS ONE 8:e Masud Rana AY, Tsujioka M, Miyagishima S, Ueda M, Yumura S (2013) Dynamin contributes to cytokinesis by stabilizing actin filaments in the contractile ring. Genes Cells 18: Matsuoka S, Shibata T, Ueda M (2013) Asymmetric PTEN distribution regulated by spatial heterogeneity in membrane-binding state transitions. PLoS Comp Biol 9:e Okamoto M, Namba T, Shinoda T, Kondo T, Watanabe T, Inoue Y, Takeuchi K, Enomoto Y, Ota K, Oda K, Wada Y, Sagou K, Saito K, Sakakibara A, Kawaguchi A, Nakajima K, Adachi T, Fujimori T, Ueda M, Hayashi S, Kaibuchi K, Miyata T (2013) TAG-1-assisted progenitor elongation streamlines nuclear migration to optimize subapical crowding. Nature Neurosci 16:

5 Shibata T, Nishikawa M, Matsuoka S, Ueda M (2013) Intracellular encoding of spatiotemporal guidance cues in a self-organizing signaling system for chemotaxis in Dictyostelium cells. Biophys J 105: 上田昌宏 (2013B). 真核細胞の走化性の物理 ( 翻訳, 原著者 :Levine H, Rappel WJ), パリティ 28(12): 蛋白質生物物理学研究室 ( 石北研 ) Saito K, Ishikita H (2013) Influence of the Ca 2+ ion on the Mn4Ca conformation and the H-bond network arrangement in Photosystem II. Biochim Biophys Acta 1837: Saito K, Ishikita H (2013) Formation of an unusually short hydrogen bond in photoactive yellow protein. Biochim Biophys Acta (Bioenergetics) 1827: Saito K, Rutherford AW, Ishikita H (2013) Mechanism of proton-coupled quinone reduction in Photosystem II. Proc Nat Acad Sci USA 110: Saito K, Rutherford AW, Ishikita H (2013) Mechanism of tyrosine D oxidation in Photosystem II. Proc Nat Acad Sci USA 110: Ishikita H, Saito K (2013R) Proton transfer and hydrogen-bond networks in protein environments. J R Soc Interface 11: 石北央 斉藤圭亮 (2013R) 蛋白質における光駆動プロトン移動と水素結合. 生物物理 53: Ishikita H (2013B) Research Frontiers: How Do Green Plants Produce O 2 from Water? Kyoto Univ Res Act 2(3):23. 石北央 (2013B) 恩師のノーベル化学賞受賞に寄せて. 光合成研究 23: 植物細胞生物学研究室 ( 高木研 ) Asada T (2013) Division of shape-standardized tobacco cells reveals a limit to the occurrence of single-criterion-based selection of the plane of symmetric division. Plant Cell Physiol 54: Sakamoto Y, Takagi S (2013) LITTLE NUCLEI 1 and 4 regulate nuclear morphology in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol 54: 理論生物学研究室 ( 藤本研 ) Fujimoto K, Sawai S (2013) A design principle of group-level decision making in cell populations. PLoS Comp Biol 9:e

6 Masaki N, Fujimoto K, Honda-Kitahara M, Hada E, Sawai S (2013) Robustness of self-organizing chemoattractant field arising from precise pulse induction of its breakdown enzyme: A single-cell level analysis of PDE expression in Dictyostelium. Biophys J 104: 学際グループ ( 荒田 G 大岡 G 古屋 伊藤 G) Catalano SR, Furuya H (2013) Two new species of dicyemid (Dicyemida: Dicyemidae) from two Australian cephalopod species: Sepioteuthis Australis (Mpllusca: Cephalopoda: Loliginidae) and Sepioloidea Lineolata (Mollusca: Cephalopoda: Sepiadariidae). J Parasitol 99: Matsuo T, Arata T, Oda T, Fujiwara S (2013) Difference in hydration structures between F-actin and myosin subfragment-1 detected by small-angle X-ray and neutron scattering. Biophysics 9: Suzuki TG, Maeda M, Furuya H (2013) Two new Japanese species of Gastrotricha (Chaetonotida, Chaetonotidae, Lepidodermella and Dichaeturidae, Dichaetura), with comments on the diversity of Gastrotrichs in rice paddies. Zootaxa 3691: Ueda K, Kimura-Sakiyama C, Aihara T, Miki M, Arata T (2013) Calcium-dependent interaction sites of tropomyosin on reconstituted muscle thin filaments with bound myosin heads as studied by site-directed spin-labeling. Biophys J 105: Yu LJ, Unno M, Kimura Y, Yanagimoto K, Oh-oka H, Wang-Otomo ZY (2013) Structure analysis and characterization of the cytochrome c-554 from thermophilic green sulfur photosynthetic bacterium Chlorobaculum tepidum. Photosynth Res 118: Oh-oka H, Blankenship RE (2013B) Green bacteria: Secondary electron donor (cytochromes). In Encyclopedia of Biological Chemistry 2nd Ed 2: 浅井智広 大岡宏造 (2013R) ホモダイマー型光合成反応中心の分子構築と反応機構. 月刊バイオインダストリー 30(12): 転出 退職したスタッフが当教室在籍時に行った研究について 2013 年に発表した論文 ( ただし 現スタッフとの共著の論文は 現スタッフ所属研究室に記載した ) Ho TV, Kamei K, Wada K, Fukuyama K, Suzuki H (2013) Thermal denaturation and renaturation of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli. Biosci Biotechnol Biochem 77:

7 Inoue T, Takao K, Yoshida T, Wada K, Daifuku T, Yoneda Y, Fukuyama K, Sako Y (2013) Cysteine-295 indirectly affects N1 coordination of carbon monoxide dehydrogenase-ii C-cluster. Biochem Biophys Res Commun 441:13-17.

8 博士学位論文 月授与 植物生長生理学研究室 ( 柿本研 ) Jewaria Pawan Kumar:Signal transduction of secretory peptides that regulate leaf epidermal patterning 核機能学研究室 ( 滝澤研 ) 渡瀬成治 :Functional analysis of the replication factor, Mcm10, in the initiation of chromosomal DNA replication in Saccharomyces cerevisiae 12 月授与生体分子機能学研究室 ( 倉光研 ) 島田敦広 :Functional analyses of the proteins involved in DNA mismatch repair 植物細胞生物学研究室 ( 高木研 ) 坂本勇貴 :Analysis of LITTLE NUCLEI family regulating nuclear morphology in Arabidopsis thaliana 3 月授与 細胞内情報伝達研究室 ( 河村研 ) 越谷祐貴 :Quantitative aspects of cgmp phosphodiesterase activation in carp rods and cones 佐藤慎哉 :AL-OL redox-coupling reaction: a novel reaction to synthesize 11-cis retinal in carp cones 学際グループ / 生体分子エネルギー変換学 G( 荒田 G) 安田哲 :Nucleotide-dependent displacement and dynamics of the α-1 helix in kinesin revealed by site-directed spin labeling EPR 石井健太郎 :Site-directed spin labeling-esr mapping of the residues of cyanobacterial clock protein KaiA and KaiC affected by KaiA-KaiC interaction 学際グループ / 動物発生進化学 G( 古屋 G) 鈴木隆仁 :Biology of Chaetonotids (Gastrotricha) taxonomy, morphology, and culture system 生命機能研究科 3 月授与分子遺伝学研究室 ( 升方研 ) 東寅彦 :A molecular mechanism of cohesion acetyltransferase-mediated cohesion establishment in Xenopus egg extracts

9 修士学位論文 2013 生体分子機能学研究室 ( 倉光研 ) 藤井裕己 ( 生命 ): バクテリア由来アーキア型ヌクレアーゼ NurA とヘリカーゼ HerA の細胞 分子機能の解析栃澤欣之 ( 生命 ): 原核生物ヒストン様蛋白質の翻訳後修飾の探索宮川武朗 ( 生命 ): 高度好熱菌由来機能未知 protein kinase の機能解析 分子遺伝学研究室 ( 升方研 ) 瀧川徹 : 分裂酵母 Sgo2 によるサブテロメア領域複製タイミング制御 林冴 : スライディングクランプ PCNA は染色体接着成立因子 Sororin の染色体結合を促進す ることで染色体複製と接着の成立を協調させる大仲惇司 : セントロメア領域特異的な組換え経路の選択機構とその意義 神経可塑性生理学研究室 ( 小倉研 ) 青木巴奈 ( 生命 ): 繰り返し LTP 誘発後の長期持続的シナプス強化における抑制性神経活動の関与志賀千明 ( 生命 ): 海馬歯状回 CA3 シナプスの構造可塑性に対する新生細胞の関与 細胞内情報伝達研究室 ( 河村研 ) 時本功輔 : 過剰な活性型視物質がもたらすトランスデューシン活性化阻害の解析 発生生物学研究室 ( 西田研 ) 宮竹将 : マボヤの Postplasmic mrnas の局在メカニズム : 結合タンパク質の同定 岸香苗 : ワカレオタマボヤ幼生期における 3 種の長距離移動細胞群の解析 植物生長生理学研究室 ( 柿本研 ) 久米佐和 : 師部細胞アイデンティティーを決定する転写因子の探索 核機能学研究室 ( 滝澤研 ) 岡本麻美 : 複製必須因子 Treslin のチェックポイント機構への関与松本侑大 : 複製開始点発火制御の解明 数理モデルを通じて 金原良樹 : 複製フォーク不安定性とレトロトランスポゾン転移頻度の関係性 理論生物学研究室 ( 藤本研 ) 境一樹 : 非拡散性因子を含むネットワークでのチューリングパターンの網羅的探索 神経回路機能学研究室 ( 木村研 ) 谷本悠生 : 新規統合型顕微鏡システムによる線虫 C. elegans の匂い応答行動のための神経基盤の解析 植物細胞生物学研究室 ( 高木研 ) 飯田幹之 : アズキ上胚軸の回旋運動は光によって誘導される

10 小松原彩加 : シロイヌナズナにおけるアクチン結合タンパク質ビリン欠損株の葉緑体逃避 反応解析 学際グループ / 生体分子エネルギー変換学分野 ( 荒田 G) 辻元由起 : 常磁性金属とスピンラベルを用いた骨格筋の細いフィラメントのカルシウム調 節におけるアクチンとトロポミオシン間の ESR 距離測定

11 学士研究論文 ( 卒業研究論文 )2013 生物科学コース基幹講座配属学生生体分子機能学研究室 ( 倉光研 ) 豊竹洋佑 : ゲルろ過クロマトグラフィーと質量分析を用いた細胞内蛋白質の網羅的相互作用解析分子遺伝学研究室 ( 升方研 ) 藤保裕樹 : 分裂酵母環状染色体を用いた複製タイミング制御の解析細胞内情報伝達研究室 ( 河村研 ) 林田和朗 : 桿体 錐体膜脂質組成の違いによるGt 活性化効率の違い多田有似 : 桿体細胞質内因子による視物質脱リン酸化反応発生生物学研究室 ( 西田研 ) 磯部美穂 : ワカレオタマボヤの発生過程の走査型電子顕微鏡による観察と記載徳久万純 : マボヤにおける卵核胞の位置と卵の動植物軸形成植物生長生理学研究室 ( 柿本研 ) 飯田浩行 : 植物胚発生における細胞運命を決定する位置情報の同定成瀬光 : クチクラ脂質輸送体 WBC11を用いた植物細胞極性形成機構の解明冨井武史 : オーキシン濃度勾配自己形成の解析に向けて核機能学研究室 ( 滝澤研 ) 岡田拓也 :G0 期細胞における複製開始抑制機構の解析中西はな :DNA 複製におけるMCMの挙動解明に向けて鍬形千絵 : 複製チェックポイント因子による複製発火制御機構の解析分子生物学 教育研究室 ( 米崎研 ) 多田峻佑 : 大腸菌 O157 株特異的な毒素 - 抗毒素系の解析細胞生物学研究室 ( 松野研 ) 岡崎紘子 : ショウジョウバエ胚消化管におけるデフォルトの左右非対称性の形成機構に関する研究神谷実咲 :Notch 情報伝達系新規構成遺伝子の探索を目的とした母性 neurogenic 遺伝子のスクリーニング石橋朋樹 : ショウジョウバエの発生における機械的な力の機能とその作用機序に関する研究 1 分子生物学研究室 ( 上田研 ) 三田村リゼッタ :A possible role of the TorC2 pathway in galvanotaxis 植物細胞生物学研究室 ( 高木研 ) 小畑響子 : シロイヌナズナ葉肉細胞の核はフォトトロピン1 依存の弱光定位運動を示す 協力講座配属学生 生体反応統御研究室 ( 長谷研 ) 太田佳佑 : 高等植物のフェレドキシンファミリーの FdC2 の研究

12 細胞外マトリックス研究室 ( 関口研 ) 戸谷勇太 : インテグリンα9ノックアウトマウスの解析下道博司 : マウス胎児線維芽細胞の間葉系幹細胞様活性に対するpolydomの寄与エピジェネティクス研究室 ( 田嶋研 ) 藤吉佑樹 : ライゲーションケミストリーを用いた修飾ヒストンの合成岡野将也 : 維持型 DNAメチル基転移酵素 Dnmt1BAHドメインの機能解析分子発生学研究室 ( 古川研 ) 吉田怜代 :Kelch-like 蛋白質 Klhl18の網膜視細胞における役割島田真理子 :4.1G 蛋白質の神経突起伸長における機能解析発癌制御研究室 ( 岡田研 ) 北野圭介 :c-srcによる細胞競合機構の解析にむけての実験系の構築 Kelvin Chen :On the concept of TCR-fate mapping in T-regulatory cells 遺伝子情報学研究室 ( 安永研 ) 山本健太郎 : オートファジー関連タンパク質の系譜検索 生命理学コース基幹講座配属学生神経可塑性生理学研究室 ( 小倉研 ) 尾崎友香 : 母性行動における神経可塑性齋藤慎一 : 繰り返しLTP 誘発後の長期持続的シナプス増強 (RISE) 生起時におけるストレス投与による樹状突起棘の動態変化水山遼 : 手続き記憶形成におけるジョロウグモ毒素の影響核機能学研究室 ( 滝澤研 ) 井上晃貴 :TopBP1によるチェックポイントを介した複製開始の制御発生生物学研究室 ( 西田研 ) 佐々木隆宣 : マボヤの表皮形成機構の解析 :GATA-a による動物半球特異的転写活性化の制御 1 分子生物学研究室 ( 上田研 ) 松浦理史 : 刺激に対する細胞膜上でのRasエフェクターの動態解析平岡陽花 : 細胞集合の中心を決める仕組みの解明について竹林和俊 :1 分子イメージングを用いた膜タンパク質の拡散係数の網羅的解析理論生物学研究室 ( 藤本研 ) 藤原基洋 : 細胞の固さの違いによる変形で三角形の細胞はできるのか吉川貴三子 : 植物の花の左右対称と回転対称を切り替えるには抑制が必要植物細胞生物学研究室 ( 高木研 ) 國安恭平 : 細胞外のカルシウムイオンを断つことはゼニゴケの葉緑体の移動にどのような影響を与えるか大塚晃弘 : シロイヌナズナにおける根の重力屈性とコルメラ細胞内アミロプラストのデンプン量との関係

13 学際グループ / 動物発生進化学分野 ( 古屋 伊藤 G) 中村太志郎 : ニハイチュウ類における頭部の形態適応学際グループ / 生体分子エネルギー変換機構学分野 ( 荒田 G) 大門大朗 :ESRによる銅 Cu(II) イオン輸送 PIB-type ATPaseの構造解析 協力講座配属学生 発癌制御研究室 ( 岡田研 ) 田中健太郎 :c-src がん形質発現のアダプター蛋白質 Dok による抑制機構 物理学科配属学生地球物理化学研究室中屋佑紀 : 腐植物質の模擬生成過程のその場分光観測の試み質量分析研究室蔵石護 : 陽子移動型反応イオン源を有するフーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析計による揮発性有機化合物の測定素粒子 核分光学研究室杉立大和 : 48 CaのSingle β 崩壊の研究 化学科配属学生高分子物理化学研究室安江彩 : 水素結合によるポリマーブレンドの特性高分子構造科学研究室柳川博斗 :FliJとFliIリング構造との複合体の形成量子化学研究室中野洋幸 :DNAポリメラーゼXにおける野生型と変異体中 dgtpの量子化学計算による安定性比較とその要因の考察生体分子化学研究室大関喜朗 : スフィンゴミエリン コレステロール間相互作用に対するスフィンゴミエリンの立体配置の寄与超分子科学研究室安達琢真 : ビナフチル基の光学異性を識別するモノクローナル抗体の作製有機生物化学研究室折井亮 : 不凍糖タンパク質 AFGPの合成研究天然物有機化学研究室中川翔 : ナチュラルキラー細胞活性化機構解析を目指したイノシトールリン脂質の合成研究高分子機能化学研究室村田圭祐 : 機能性触媒の創薬を目指した遷移金属錯体に対するモノクローナル抗体の作製

14 年譜 2013 年 ますかたひさお きむらこうたろう ふじもとこういち 4 月 1 日升方久夫 専攻長 学科長に就任 木村幸太郎 藤本仰一両アプレンティス プログラム特任准が専攻の准として着任 4 月 2 日入学式 生物科学科入学者 60 名 ( うち生物科学コース 28 名 生命理学コース 32 名 ) 今年度より全員前期日程試験による合格者 2013 年度学部入学者担任は にしだひろき ふじもとこういち 生物科学コース西田宏記 生命理学コース藤本仰一准 大学院生物科学専攻博士前期課程入学者 49 名 (G30 統合理学コース1 名含む ) 博士後期課程入学者 16 名 (G30 統合理学コース 2 名含む ) 4 月 3 日新入生学部別 学科別履修指導 4 月 4 日大学院新入生オリエンテーション 4 月 15 日大学院入試説明会 オープンラボ (1 回目 参加者 45 名 ) 4 月 日新入生リトリート 兵庫県立人と自然の博物館訪問 箕面市立青少年教学の森野外活動センター宿泊 参加者 1 回生 60 名 その他学生 教員含め約 70 名 5 月 2-3 日いちょう祭 生物学科 生物科学専攻の活動紹介 JT 生命誌館特別展示 生き物の展示 牛のハンドリング講座 ハエの間違い探し 花の染色 気孔の観察 ルシフェラーゼ GFP の観察 光る生き物 ( 蛍光 ) の観察 DNA 抽出 手回し遠心機で遊ぼう 葉っぱ標本の作製 DNA ビーズの作成 チップつめ競争 ピペットマンで遊ぼう 生物学科の各研究室のポスター紹介 入場者 680 名 ( 責任者は小沼健助教 ) 5 月 16 日生物科学専攻博士論文業績発表会 (2 名 ) 5 月 日台湾国立清華大学 - 大阪大学学生シンポジウム開催 ( 滝澤温彦世話人 ) 大阪大学蛋白質研究所にて開催 台湾からの大学院生数 8 名 台湾からの教員数 3 名 専攻大学院生参加者数 10 名 教員参加者数約 10 名 6 月 24 日大学院入試説明会 オープンラボ (2 回目 参加者 28 名 ) くまのがく 6 月 30 日熊野岳助教 ( 西田研究室 ) が東北大学大学院生命科学研究科附属浅虫海洋生物学 教育研究センターに転出 いしきたひろし 7 月 1 日石北央 ( 京都大学より ) 着任 かみやのぶろう 7 月 13 日神谷宣郎先生生誕百周年記念シンポジウムを大阪大学会館にて開催 参加者約 70 名 8 月 13 日生物科学専攻博士論文業績発表会 (2 名 ) 8 月 20 日高校生対象理学部オープンキャンパス実施 ( 訪問者数は 理学部全体で約 2,400 名 生物科学科約 440 名 模擬授業参加者 (2 回計で 121 名 ) 8 月 23 日生物科学専攻修士論文業績発表会 (G30 コース 1 名 ) 8 月 日第 34 回高校生対象公開実習 科学的キャリア教育大阪大学分子生物学実習 ジャイアントインパクト ( 高校生 33 名 高校教諭 4 名 増井准 吉本研究員 ) 9 月 日生物科学科 - 学年縦断合宿 ( 学生企画 中川拓郎准担当 ) 海遊館( 大阪市 ) 見学 丸三旅館 ( 滋賀県 ) 宿泊 学部生 54 名 大学院生 2 名 教員 4 名参加 外部からの講演者 2 名

15 9 月 30 日博士前期課程 1 年次生研究中間報告会 終了後 懇親会 さいとうけいすけ 10 月 1 日石北研究室斉藤圭亮助教 ( 科学技術振興機構より ) 着任 10 月 1 日生物科学専攻 G30 統合理学特別コース博士前期課程 1 名 博士後期課程 2 名入学 10 月 20 日高校生のためのタンパク質科学実習 ホタライトを用いた科学的キャリア教育 ( 高校生 36 名 高校教諭 4 名 大学関係者など 3 名 倉光成紀 吉本研究員 ) 11 月 17 日高校生のためのタンパク質科学実習 ホタライトを用いた科学的キャリア教育 ( 高校生 27 名 中学生 1 名 小学生 1 名 高校教諭 保護者 15 名 倉光成紀 吉本研究員 ) 11 月 19 日生物科学専攻博士論文業績発表会 (2 名 ) 12 月 日スーパーサイエンスハイスクール実習 発生生物学実習 : ホヤ胚の筋肉分化のしくみを探る ( 福井県立武生高校生 30 名 高校教諭 3 名 西田宏記 ) 12 月 26 日理学部研究奨励 AO 入試第 2 次選抜 ( 面接 )(1 月 9 日の学部入試委員会で生物科学コース 4 名 生命理学コース 2 名を合格とし 2 月 7 日の第 3 次選抜 ( センター入試 ) で 6 名全員合格 ) 12 月 日第 35 回高校生対象公開実習 ( 高校生 40 名 高校教諭など 11 名 増井良治准 吉本研究員 ) 2014 年 2 月 1 日大学院博士前期課程 2 次募集試験 ( 受験者数 6 名 4 名合格 ) 大学院博士後期課程入試 ( 受験者 1 名で 1 名合格 ) 2 月 5-6 日卒研配属説明会 研究室紹介 生物科学コース 生命理学コースの学生に対し 吹田キャンパスの研究室を含めて実施 2 月 日生物科学専攻修士業績発表会 修士学位認定 44 名 (G30 コース 1 名含む ) 博士後期課程入学試験にて内部進学者 6 名合格 ( 外部からの入学者 G30 統合理学コース入学者を合わせて 8 名入学 ) 2 月 17 日生物科学専攻博士業績発表会 博士学位認定 9 名 ( 月認定を合わせると 15 名学位取得 ) 2 月 18 日生物科学専攻博士後期課程入学試験 (1 名受験 1 名合格 ) 2 月 21 日生物科学科生命理学コース卒業研究発表会 (D501 大講義室 ) 2 月 22 日生物科学科生物科学コース卒業研究発表会 (D501 大講義室 ) 3 月 6 日生物科学専攻 G30 統合理学特別コース博士後期課程入試 ( 受験者 1 名 合格者 1 名 ) 3 月 10 日生物科学専攻 博士後期課程院生による中間報告会を開催 3 月 25 日卒業式 学部卒業者 52 名 ( 生物科学コース 25 名 生命理学コース ( 第 3 期生 )27 名 ) 学位授与式 本年度博士前期課程修了者 44 名 博士後期課程修了者 ( 学位取得者 ) 9 名 ( 月認定を合わせて 15 名 ) 卒業祝賀会 ( 生物同窓会主催 ) 開催 3 月 31 日石北央が東京大学大学院工学系研究科応用化学専攻に転出

16 かきもとたつおいまいさとうかおる 4 月 1 日専攻長 学科長を升方から柿本辰男に交代 西田研究室に今井 ( 佐藤 ) 薫 准 ( 京都大学理学研究科より ) 着任

17 平成 26(2014) 年度理学研究科執行部 平成 26 年 4 月 1 日現在 研究科長 篠原厚 ( 化学 ) 評議員 ( 筆頭副研究科長 ) 小川哲生 ( 物理 ) 副研究科長 深瀬浩一 ( 化学 ) 青島貞人 ( 化学 ) 上田昌宏 ( 生物 ) 専攻長 数学専攻長 盛田健彦 物理学専攻長 山中卓 化学専攻長 水谷泰久 生物科学専攻長 柿本辰男 高分子科学専攻長 山口浩靖 宇宙地球科学専攻長 常深博

18 教室スタッフ ( 含研究員 ) 一覧 平成 26 年 4 月 1 日現在 専攻長 学科長柿本辰男 教員 研究員 生体分子機能学研究室 倉光成紀 准 増井良治 助教 中川紀子 分子遺伝学研究室 升方久夫 准 中川拓郎 助教 高橋達郎 神経可塑性生理学研究室 ( 生命機能研究科 ) 小倉明彦 准 冨永 ( 吉野 ) 恵子 細胞内情報伝達研究室 ( 生命機能研究科 ) 河村悟 准 橘木修志 助教 和田恭高 研究員 越谷祐貴 研究員 佐藤慎哉 発生生物学研究室 西田宏記 准 今井 ( 佐藤 ) 薫 助教 小沼健 特任助教 山田温子 (G30) 植物成長生理学研究室 柿本辰男 教教 高田忍 助教 田中博和 核機能学研究室 滝澤温彦 准 久保田弓子 助教 三村覚 特任助教 卓妍秀 (G30) 分子生物学 教育研究室 米崎哲朗 特任准 Thorsten Henrich(G30) 細胞生物学研究室

19 松野健治 助教 山川智子 助教 笹村剛司 ( 生命理学コース ) 研究員 中村充利 研究員 石尾彬 研究員 羽鳥僚 1 分子生物学研究室 上田昌宏 助教 宮永之寛 研究員 内川徹 研究員 安井真人 理論生物学研究室 准 藤本仰一 神経回路機能学研究室 准 木村幸太郎 学際グループ 准 荒田敏昭 准 大岡宏造 准 高木慎吾 准 古屋秀隆 講師 伊藤一男 助教 浅田哲弘 特任助教 Md. Sayeedul Islam(G30) 研究員 高松秀安 技術職員 技術員 大森博文 事務職員 事務補佐員 市川麻世 ( 西田研秘書 ) 事務補佐員 井ノ口左恵 ( 荒田 G 木村研 藤本研秘書 ) 事務補佐員 宇田祐子 ( 倉光研 高木 G 秘書 ) 事務補佐員 隅田理恵 ( 升方研 上田研秘書 ) 事務補佐員 髙嶋典子 ( 米崎研 古屋 G 秘書 教務事務補佐 ) 事務補佐員 山口綾子 ( 小倉研 河村研秘書 ) 事務補佐員 吉田美津子 ( 松野研秘書 専攻長事務補佐 ) 事務補佐員 三枝陽子 ( 全学教育推進機構 ) 事務補佐員 池上恵子 ( 全学教育推進機構 )(5 月まで ) 宗村章子 (6 月より )