REAXYS NEW REAXYS. RAEXYS 教育訓練 PPT HOW YOU THINK HOW YOU WORK

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Tobias Phelps
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1 REAXYS HOW YOU THINK HOW YOU WORK RAEXYS 教育訓練 PPT NEW REAXYS. 1

2 REAXYS 化學資料庫簡介 CONTENTS 收錄內容 & 界面更新資料庫建置原理個人化功能 Searching in REAXYS 主題 1 : 化合物搜尋主題 2 : 反應搜尋主題 3 : 合成計畫主題 4 : 文獻搜尋 Analyzing in REAXYS 視覺化分析工具 Analysis View 多樣化結果輸出功能 Enhanced Report 自動合成工具 Autoplan 相關資源 2

3 REAXYS 化學資料庫簡介 3

4 REAXYS 化學資料庫收錄內容收錄自 1771 年起的 16,000 筆化學相關出版品, 涵蓋有機化學無機化學及有機金屬三大資料庫及專利!!! 內容涵蓋學科領域已從核心 400 本嚴選化學期刊到以下學科 : Agricultural and Biological Sciences Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Chemical Engineering Chemistry Dentistry Earth and Planetary Sciences Energy Engineering Environmental Science Immunology and Microbiology Materials Science Medicine Neuroscience Pharmacology, Toxicology and Pharmaceutics Physics and Astronomy Veterinary 4

5 REAXYS 操作介面更新及功能新增 REAXYS 化學資料庫使用介面簡單且不受使用人數限制! 三大新功能讓您不僅作搜尋也能同時進行分析和出搜尋到的資料! 5

6 REAXYS 資料擷取方式從文獻中擷取出化學結構物理化學特性藥理資訊以及化學合成反應式, 再將這些資訊分成三大類 (SUBSTANCES REACTIONS 及 CITATIONS), 一共個參數 ( 如下兩張投影片 )! 讓您以化合物的角度輕鬆獲取相關資訊! 6

7 REAXYS DATASTRUCTURE Substances Physical Properties Structure and Energy Parameters Physical State Crystals Liquids Gases Other Physical and Mechanical Properties Transport Phenomena Viscosity Thermochemical Data Enthalpy Heat Capacity Optical Properties Spectroscopic Information Magnetic Properties Electrical Properties Electrochemical Behaviour Safety Data Solution Behaviour (MCS) Liquid/Vapour Systems (MCS) Pharmacological and Ecological Data Quantum chemical data Compound Labels INCHI code Catalyst Investigation Derivative Isolation from natural products Purification Conformation Interatomic Distances and Angles Electrical Moment Electrical Polarizability Molecular Deformation Energy Barriers Dissociation Energy Ionization Potential Electron Binding Crystal Property Description Melting point Decomposition Sublimation Crystal Phase Triple Point Transition Point(s) of Cystalline Crystal System Space Group Density of the Crystal Boiling point Liquid Phase Transition Point(s) of Liquid Modification Critical Temperature Critical Pressure Critical Density Critical Volume Vapour Pressure Gas Phase Density of the Liquid Mechanical Properties Compressibility Sound Properties Surface Tension Dynamic viscosity Kinematic viscosity Bulk Viscosity Self-diffusion Chromatographic Data Transport Data Thermal Expansion Enthalpy of Combustion Enthalpy of Formation Enthalpy of Hydrogenation Enthalpy of Fusion Enthalpy of Vaporization Enthalpy of Sublimation Enthalpies of Other Phase Transitions Heat Capacity Cp Heat Capacity Cp0 Heat Capacity Cv Other Thermochemical Data Refractive index Optics Optical rotatory power Mutarotation Circular Dichroism Optical Rotatory Dispersion NMR Spectroscopy ESR Spectroscopy NQR Spectroscopy Rotational Spectroscopy IR Spectroscopy Raman Spectroscopy UV/VIS Spectroscopy Luminescence Spectroscopy Fluorescence Spectroscopy Phosphorescence Spectroscopy Other Spectroscopic Methods Mass spectrum Magnetic Susceptibility Magnetic Data Static Dielectric Constant Dielectric Constant Electrical Data Electrochemical Behaviour Dissociation Exponent Isoelectric Point ph Electrochemical Characteristics electrolytic conductivity electrochemistry data Cross-Sections Flash Point Autoignition Explosion Limits Further Information Solubility (MCS) Solubility Product (MCS) Solution Behaviour (MCS) Critical Micelle Concentration (MCS) Henry Constant (MCS) Partition coefficient Liquid/Vapour Systems (MCS) Azeotropes (MCS) Complex Phase Equilibria (MCS) Liquid/Liquid Systems (MCS) Liquid/Solid Systems (MCS) Mechanical and Physical Properties (MCS) Transport Phenomena (MCS) Energy Data (MCS) Electrical Data (MCS) Optical Data (MCS) Boundary Surface Phenomena (MCS) Adsorption (MCS) Association (MCS) Pharmacological Data Use Quantum chemical calculations 7

8 Reactions Reaction Reactant Product Reaction Transforms Bin Reaction Details Multistep Reaction ID Number of Reaction Steps Multistep Reaction Description Reaction classification Product Yield Optical yield No. of Stages Reagent Name Catalyst Solvent Time Temperature Pressure ph Reaction conditions Reaction Type Subject Studied Prototype Reaction Named reaction REAXYS DATASTRUCTURE Citations Citation Document Type Authors Patent Assignee Article Number Patent Country Code Patent Number Patent Year Patent Language Code CODEN Journal Title Journal/Review without CODEN Country Code Language code Editor Publisher Location of Publisher (Series) Volume Number REACTIONS & CITATIONS Publication Year Page DOI ISSN Title Abstract Language Keywords Patent Bibliography Date of publication Application number Date of filing Filing year Inventor Priority number Priority date Main IPC Secondary IPC Family member: Patent number 8

9 REAXYS 資料篩選和資料庫建置示意圖化學領域相關出版品 Excerption Scientific Model 化合物化合物相關的物化特性實驗數據,Facts 製備方法反應文獻資料化合物和反應實驗數據, Facts 文獻資料另外還增加其他相關資訊, 如 : 摘要, Markush 等選 / 收錄和組織化 9

10 REAXYS 搜尋結果資料呈現方式書目資料化學結構反應資訊實驗數據 10

11 REAXYS 化合物資料擷取實例 11

12 REAXYS 化合物物理化學特性資料擷取實例 Color / habit Color Dark red NMR Spectroscopy Nucleus Solvent Signals / Intensities 1H CD2C12 available Mass Spectroscopy Diagram (MS. DGM) Molecular park (MS. PEAK) Fragmentation (MS. FRAG) Description (MS. DESCR) available available 12

13 REAXYS 反應資料擷取實例 13

14 REAXYS 書目資料擷取實例 14

15 REAXYS 全方位支援您的化學研究流程豐富的資訊 : 以化學人的邏輯, 將化合物結構反應式物理化學特性光譜資料等資料從化學文獻資料中取出! 再用 REAXYS 特有呈現搜尋結果方式, 將化學相關搜尋結果以化合物或是反應為主體做編排! 最後提供 ELN / MSWord / Excel / PDF / API / SFF 等方式讓化學研究人員將最佳工作流程解答輸出! 註 15

16 REAXYS 聯結多種資料庫, 資訊獲取更便利為了讓使用者能容易查找相關資訊,REAXYS 聯結到許多 ELSEVIER 內部或外部資料庫, 讓使用更加便利 PUBCHEM 在 REAXYS 介面在您搜尋資料結果時可以連到 NCBI 開放的資料庫, 以獲取小分子生物活性資料 EMOLECULES 可以獲取國外原料藥的購買資訊, 包含廠牌容量與價格, 以幫助合成或購買的決策過程 REAXYS MEDICINAL CHEMISTRY 根據分子標靶藥理作用和標靶相互作用數據之主要資料來篩選和優先考慮候選藥物 PHARMAPENDIUM 深入臨床和臨床前數據, 並能搜尋 FDA 內的藥品審查資訊及相關歷史資料 SCOPUS 享有使用重要的文獻計量學的資訊結果, 包含引用資訊及期刊分析等 SCIENCEDIRECT 可獲取 ELSEVIER 文章和電子書全文資料下載及使用多種便利的應用程式 16

17 REAXYS 首頁新版資料庫入口有三種入口 : 依結構搜尋非依結構搜尋及文獻搜尋, 方便不同領域使用者選擇進入! 依結構搜尋 (Structures & Reactions): 可輸入化學結構來搜尋反應式化合物及文獻, 並可按下 Reaction Data 加入附加搜尋條件非結構搜尋 (Names & Formulas): 可輸入化學名稱等方式來搜尋特定化合物, 並可按下 Physical Spectra Bio Activity 及 Natural Product 加入附加搜尋條件文獻搜尋 (Literature): 可選擇欄位並輸入關鍵字來搜尋相關文獻附加搜尋條件設定 17

18 SEARCH IN REAXYS 18

19 主題 1 : 化合物搜尋 _ 非依結構搜尋非依結構搜尋 : 適用於初學者一開始進行化學搜尋或任何不易以畫結構方式做搜尋的分子, 如 : 無機分子 19

20 主題 1 : 化合物搜尋 _ 非依結構搜尋 20

21 PRESENTER NAME DATE TITLE 主題 1 : 化合物搜尋 _ 依結構搜尋依結構做搜尋 : 使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式, 或是藉由化合物名轉換成結構的方式做搜尋! 21

22 主題 1 : 化合物搜尋 _ 依結構搜尋搜尋項目 : 可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應化合物及文獻反應搜尋條件 : 基本設定另可依據化合物名稱 InChI-Key 及 Smiles 來做搜尋若要增加搜尋條件可按下 Physical Spectra Bio Activity 及 Natural Product 加入附加搜尋條件 22

23 MARVINSKETCH Reaxys Generics Template Library 利用 MarvinSketch 線上繪圖軟體繪製分子 / 試劑結構 Periodic System 23

24 主題 1: 搜尋範例 - THALIDOMIDE THALIDOMIDE 是最早上市的非處方鎮定劑, 很多國家曾用於懷孕婦女的噁心嘔吐症狀, 卻也造成在 1960 年代上千位畸形兒的產生, 因此而聲名狼藉! 最近幾年讓一些研究學者更感興趣的是 Thalidomide 的 : 1. 抗發炎作用 (anti-inflamatory) 2. 免疫調節 (Immunomodulatory) 3. 抑制血管增生 (anti-angiogenic) 抗血管新生作用 (Antiangiogenesis Activity) (1) 血液腫瘤 (2) 多發性骨髓瘤 (Multiple Myeloma) (3) 肝癌 (Hepatocellular Carcinoma, H.C.C.) 不良反應 (1) 致畸胎 (2) 週邊神經病變 (3) 副作用 : 嗜睡, 暈眩等參考網站 : 24

25 主題 1 : 化合物搜尋 _ 結果畫面 BIOACTIVITY/ECOTOX 25

26 主題 1 : 化合物搜尋 _ 結果畫面 PHYSICAL DATA/SPECTRA 26

27 主題 1 : 化合物搜尋 _ 輸出 Report October 14, 2013 Slide 27 27

28 ANALYZING IN REAXYS 多樣化結果輸出功能 Enhanced Report 28

29 主題 1 : 化合物搜尋 _REPORT 多樣化結果輸出功能 (REPORT): 只要有圖示處皆可輸出至 REPORT, 如 : 搜尋條件搜尋結果及合成計畫等 29

30 主題 2 : 反應搜尋 _ 依結構搜尋依結構做搜尋 : 使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式, 或是藉由化合物名轉換成結構的方式做搜尋! 30

31 主題 2 : 反應搜尋 _ 依結構搜尋搜尋畫面搜尋項目 : 可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應化合物及文獻啟用線上繪圖軟體 MarvinSketch/Elemental 來畫結構反應搜尋條件另可依據化合物名稱 InChI-Key 及 Smiles 來做搜尋提供 Elemental MarvinSketch 等讓使用者選擇繪製分子結構或反應的軟體 ; 預設為 MarvinSketch( 需 JAVA 支援 ), 可點擊空白處兩下以啟動搜尋 : 反應化合物 & 文獻搜尋 31

32 主題 2 : 反應搜尋 _ 附加搜尋選項 REACTION DATA October 14, 2013 Slide 32 32

33 ELEMENTAL 利用 Elemental 線上繪圖軟體繪製分子結構 / 反應式 Element Chooser Reaxys Generics 33

34 主題 2 : 反應搜尋 _ THALIDOMIDE 沙利竇邁的合成 THALIDOMIDE 輸入化合物名稱 Thalidomide 並轉換成結構 34

35 限縮項目 : 建議使用 Analysis View 以圖像的方式同時分析兩種欄位主題 2 : 反應搜尋 _ 結果畫面輸搜尋結果 35

36 主題 2 : 反應搜尋 _ 結果畫面文獻連結 36

37 主題 2 : 反應搜尋 _ 結果畫面匯出至報告 Report 37

38 ANALYZING IN REAXYS 視覺化分析工具 Analysis View 38

39 視覺化分析工具 - ANALYSIS VIEW 39

40 主題 3 : 合成計畫 - THALIDOMIDE 開啟合成計畫 - SYNTHESIS PLANS 40

41 主題 3 : 合成計畫 - THALIDOMIDE 開啟合成計畫 - MANUALLY 一步一步建立合成計畫 41

42 主題 3 : 合成計畫 - THALIDOMIDE 開啟合成計畫 - MANUALLY 42

43 ANALYZING IN REAXYS 自動合成計畫 AUTO PLAN 43

44 主題 3 : 合成計畫 - THALIDOMIDE 開啟合成計畫 - AUTO PLAN 一次開啟所有合成計畫 44

45 主題 3 : 合成計畫 - THALIDOMIDE 匯出至報告 45

46 主題 3 : 合成計畫 - THALIDOMIDE 報告內容 ] 及時寄送功能! 46

47 主題 4 : 文獻搜尋入口畫面 47

48 主題 4 : 文獻搜尋輸入關鍵字 48

49 主題 4 : 文獻搜尋附加搜尋選項 49

50 主題 4 : 文獻搜尋搜尋結果畫面 50

51 主題 4 : 文獻搜尋 51

52 主題 4 : 文獻搜尋 PRESENTER NAME DATE TITLE 52

53 多樣化結果輸出功能 - ENHANCED REPORT 搜尋紀錄輸出輸出結果反應搜尋結果輸出化合物搜尋結果輸出文獻搜尋結果輸出 53

54 相關資源 54

55 相關資源 Reaxys info : 55

56 ELSEVIER 台灣官網 : REAXYS 資訊下載 56

如有相關問題請連絡劉惠賢 KAREN.LIU@ELSEVIER.COM 電話 :(02)2522-5911 相關網頁 WWW.REAXYS.

57 如有相關問題請連絡劉惠賢電話 :(02) 相關網頁 ( 首頁 ) TAIWAN.ELSEVIER.COM ( 台灣官網 ) (FB 粉絲團 ) 57

0 0 = 1 0 = 0 1 = = 1 1 = 0 0 = 1

0 0 = 1 0 = 0 1 = = 1 1 = 0 0 = 1 0 0 = 1 0 = 0 1 = 0 1 1 = 1 1 = 0 0 = 1 : = {0, 1} : 3 (,, ) = + (,, ) = + + (, ) = + (,,, ) = ( + )( + ) + ( + )( + ) + = + = = + + = + = ( + ) + = + ( + ) () = () ( + ) = + + = ( + )( + ) + = = + 0